处理完成 嗜碱湖畔菌SGAR-12菌株基因组测序揭示其在生物脱硫中的应用潜力

为优化生物脱硫(BD)技术，来自荷兰瓦赫宁根大学的研究人员对从 pilot-scale haloalkaline BD装置中分离的硫化物氧化细菌Alkalilimnicola ehrlichii SGAR-12菌株进行了基因组测序，并与该物种的模式菌株MLHET进行了比较分析，揭示了两者在硫利用谱上的潜在差异，为提升生物脱硫效率提供了基因组学基础。

　　

在荷兰瓦赫宁根大学校园的一个 pilot-scale haloalkaline 生物脱硫(BD)系统中，科学家们发现了一种占主导地位的硫化物氧化细菌——Alkalilimnicola ehrlichii SGAR-12。这种特殊的微生物在氧气限制条件下(12% v/v)，于pH 8.5的盐碱矿物培养基中茁壮成长，温度保持在35°C。

研究人员通过序列稀释法富集了SGAR-12菌株，并在相同的培养基上获得了纯培养物。为了深入了解这种细菌的遗传特性，他们采用了混合基因组组装策略，结合Illumina NovaSeq 6000和Oxford Nanopore测序平台对SGAR-12及其模式菌株MLHE^T(DSM 17681^T)的基因组进行了测序。

测序结果显示，SGAR-12和MLHE^T均形成了单一的环状contig，基因组大小分别为3,194,001 bp和3,264,331 bp。基因组注释发现，SGAR-12拥有2,924个基因，其中包括2,816个蛋白质编码基因和50个假基因；而MLHE^T则有2,954个基因，包含2,883个蛋白质编码基因和13个假基因。这项研究为理解Alkalilimnicola属细菌在haloalkaline环境中的硫代谢机制奠定了重要基础。