基于深度学习与MR影像的脑转移瘤精准预测模型:一项聚焦准确性的开发与验证研究

【字体: 时间:2025年09月24日 来源:Frontiers in Oncology 3.3

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  本研究开发并验证了一种基于3D U-Net(ResNet-34主干网络)的深度学习模型,利用磁共振成像(MRI)实现脑转移瘤(BM)的自动分割与诊断。模型在内部测试集与外部验证集中均展现出完美特异性(Specificity=1.0000)和高精度(Precision>0.93),且在不同性别、年龄组中表现稳健。尽管在肺癌亚组中敏感性(AUC=0.82)略低于其他癌症类型(AUC=0.89),但其识别效率显著高于人工标注(时间减少40%-50%),为临床转化提供了高效、可靠的AI辅助诊断工具。

  

背景:脑转移瘤(Brain Metastases, BM)作为最常见的成人颅内恶性肿瘤,起源于颅外原发性肿瘤,具有隐匿性强、进展迅速和预后差等特点。其发生率在实体瘤患者中高达10%-40%,准确识别BM对临床决策和患者生存至关重要。然而,传统依赖医师手动识别MRI影像中多发(尤其是微小)转移灶的方法,不仅耗时且漏诊风险高。因此,开发高效、精准的自动识别技术成为临床迫切需求。

方法:本研究采用回顾性多中心设计,共纳入642例患者。其中,470例来自江苏省肿瘤医院(训练集379例,内部测试集91例),172例来自南京大学医学院附属鼓楼医院(外部验证集)。所有患者均经临床确诊为BM并完成脑部增强MRI扫描。纳入标准包括年龄≥18岁、影像无伪影或失真;排除标准涵盖危重状态、仅平扫MRI及存在MRI禁忌症等。

影像采集使用Philips 3.0T超导MRI仪,采用32通道头线圈和钆喷酸葡胺(Gd-DTPA)增强对比剂(剂量0.25 mL/kg,流速1 mL/s),延迟3分钟后进行3D-T1WI序列扫描(参数:矩阵256×256,层厚1 mm,TR/TE=6.6/3.0 ms,FOV 240×240,体素大小1 mm3)。三名8年以上经验的磁共振医师独立审片,手动勾画增强病灶(分为结节状均匀强化、环状强化和不规则强化三类),并作为金标准分割掩模。

模型构建基于3D U-Net架构,以ResNet-34为编码器骨干,采用ImageNet预训练权重初始化。预处理流程包括:将MRI重采样至0.833 mm3各向同性体素、使用SynthStrip进行颅骨剥离、Z-score强度归一化。训练策略采用128×128×128体素的块采样、volumentations数据增强(左右翻转、弹性形变和伽马调整)及混合损失函数(Dice损失 + 二元交叉熵)。优化器为Adam(学习率0.0001,β1=0.9,β2=0.999,ε=1×10?7),在NVIDIA RTX 4090 GPU(64 GB内存)上以批大小4训练。

推理阶段采用重叠块策略(步长64体素),预测结果平均融合后以0.5阈值生成二值分割掩模。评估指标涵盖曲线下面积(AUC)、Dice系数、F1分数、交并比(IoU)、马修斯相关系数(MCC)、精确率(Precision)、召回率(Recall)和特异性(Specificity)。统计分析使用R语言(4.4.1版),连续变量以均值±标准差或中位数(四分位距)描述,组间比较采用t检验、Mann-Whitney U检验或χ2检验,AUC差异通过DeLong检验评估,P<0.05视为显著。

结果:患者基线特征显示,内部测试集与外部验证集在年龄(59.4±10.2岁 vs 57.4±12.6岁)和性别上无显著差异,但癌症类型分布存在选择性偏倚(肺癌占比差异显著)。

模型在内部测试集和外部验证集的核心性能分别为:AUC 0.89(0.79–0.93) vs 0.82(0.67–0.90),精确率>0.93,特异性均达1.0000(1.0000–1.0000)。但召回率从测试集的0.78(0.57–0.86)降至验证集的0.64(0.34–0.81),伴随F1分数(0.82→0.75)、Dice系数(0.82→0.75)和MCC(0.82→0.77)同步下降,提示模型鲁棒性中等且敏感性有待优化。与医师手动标注相比,模型检出病灶数显著更高,有效降低了漏诊率。

分层分析揭示:

  • 性别维度:男性和女性组间除AUC外无显著差异(P>0.10),特异性均保持1.0000,模型稳定性跨性别一致。

  • 年龄维度:<60岁与≥60岁组在多数指标上无统计学差异(P>0.20),但≥60岁组召回率分布下限较低(Q1=0.5540),提示老年群体敏感性需提升。

  • 癌症类型维度:内部测试中,肺癌(n=74)与其他癌症(n=17)的AUC差异显著(P<0.001),但其他指标无显著区别(P>0.13);外部验证中,其他癌症(n=79)的精确率显著高于肺癌(n=93)(P<0.05),且肺癌AUC(0.82)显著低于其他癌症(0.89)(P<0.001),表明模型对非肺癌恶性肿瘤判别更具优势,而对肺癌敏感性存在依赖性。

时间效率分析显示,模型标注耗时显著短于人工(内部集:69s vs 113s;外部集:66s vs 96s,均P<0.001),且与人工标注一致性高。

讨论:本研究通过多中心、多维度验证证实,所开发的3D U-Net模型在BM诊断中具有完美特异性和跨人口学特征的稳健性,其高效性(耗时减少40%-50%)为临床提供了切实可行的AI辅助工具。尽管模型在肺癌敏感性上存在优化空间,但其整体性能优于既往研究(如Fajam等敏感度93.5%、Gong等Dice系数0.72)。仅依赖CE-T1WI序列的策略平衡了精度与临床普适性,避免了多模态序列的额外成本。未来需扩大样本量、优化肺癌敏感性并验证于更大规模多中心数据,同时开展病灶大小分层分析以进一步提升小病灶检出率。

结论:该深度学习模型在BM自动分割中展现出卓越的特异性、鲁棒性和高效性,虽存在癌症类型依赖性,但其临床转化潜力显著,有望成为提升脑肿瘤影像诊断精度与效率的有效工具。

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