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HNMD-CNN:基于分层窄化多深度卷积神经网络的3D MRI图像胶质瘤精准分类新方法
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年09月24日 来源:Computational and Systems Oncology CS4.6
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本综述系统介绍了HNMD-CNN(分层窄化多深度卷积神经网络)在3D MRI图像胶质瘤分类中的创新应用。该方法通过模拟放射科医生的诊断逻辑,采用由大到小的分层滤波策略(13×13至3×3),整合多模态MRI序列(FLAIR、T1、T1ce、T2),在BraTS2018/2019数据集上实现了99.93%的分类准确率,显著提升了胶质瘤(HGG/LGG)的诊断精度与收敛速度,为AI辅助脑肿瘤早期检测提供了重要工具。
脑肿瘤作为罕见但高风险的疾病,常因诊断延迟而进展至危重阶段。胶质瘤根据世界卫生组织(WHO)标准分为高等级(HGG)和低等级(LGG),其早期识别对降低死亡率至关重要。尽管二维成像技术已提升诊断水平,三维成像却能提供更全面的视角。本研究提出一种新颖的分层窄化多深度卷积神经网络(HNMD-CNN),利用3D MRI图像对脑肿瘤进行分类,其设计灵感源于放射科医生的分层诊断模式:先通过大尺度滤波器定位肿瘤区域并提取全局特征,再逐步使用小尺度滤波器聚焦细节特征,从而优化特征表征并提升诊断准确性。
MRI序列如T1、T1ce(对比增强)、T2和FLAIR可差异化显示肿瘤区域,辅助界定肿瘤边界及浸润程度。扩散张量成像(DTI)和灌注加权成像(PWI)等进阶技术进一步捕获肿瘤侵袭性。这些序列在矢状、轴向和冠状平面上提供独特特征,构成分层窄化诊断的基础(表1)。例如,FLAIR突显水肿区域,T1提供解剖细节,T1ce识别血脑屏障破坏,而T2检测水分异常。
人工智能(AI)与机器学习(ML)方法,尤其是卷积神经网络(CNN),已成为脑肿瘤诊断的革命性工具。CNN能分析医学图像中的复杂模式,识别人眼难以察觉的特征。结合分层诊断框架,AI可初步筛查MRI图像中的可疑区域,再进行精细分类,从而加速决策过程。近期研究表明,MRI与AI结合显著提高了胶质瘤分类准确性,特别是区分HGG与LGG。融入分子与遗传数据进一步提升了诊断全面性。
本研究旨在探索分层窄化方法在脑肿瘤诊断中的实用性,重点关注两大问题:
分层窄化策略在整合先进MRI技术与AI分析时,如何提升分类准确性?
在此框架内加入分子与遗传数据是否会增强胶质瘤分级的精确性?
表2综述了近年基于深度学习的脑肿瘤分类方法,涵盖CNN、U-Net、迁移学习等多种模型,其在BraTS等数据集上的表现凸显了技术进步。例如,2016年Pereira等人采用3×3核CNN在BraTS2015上取得Dice系数0.88;2022年Ullah等人的TumorResNet实现99.33%准确率;而2023年多项研究准确率已逼近99%。
面对高数据量与复杂结构,预处理管道首先去除无关区域(如非信息性边缘),接着进行标准化与归一化,最后缩放图像以降低维度而不损失关键特征。
MRI图像可作为独立切片或集合使用,后者通过聚合多切片信息增强特征提取。模型同步处理FLAIR、T1、T1ce和T2四种模态(图3),整合各模态特征以提升鲁棒性。多模态整合之所以关键,是因为每种序列贡献独特诊断信息:FLAIR显示水肿,T1呈现结构,T1ce揭示活性肿瘤,T2凸显水分异常,共同全面表征肿瘤形态。
HNMD-CNN采用分层窄化方法,起始用大核(13×13)捕捉整体结构,逐步过渡至小核(3×3)聚焦病灶细节(图4),模拟放射科医生的认知流程:从全局异常筛查到局部精细分析。该策略提升定位精度与诊断一致性。
经大量实验优化,模型最终采用Leaky ReLU(α=0.2)激活函数、批归一化及20%丢弃率以防止过拟合。其核心创新在于分层窄化策略,取代传统CNN的均匀核大小,从而无需注意力或循环层即实现高性能。图5展示了模型架构,包括五层卷积、层次化参数调优(共九级),以及Adam优化器(学习率0.001)。
研究评估三种数据准备技术(图6):
技术1:合并T1、T1ce、T2、FLAIR四种模态切片(41-120);
技术2:添加分割图像(若非零值);
技术3:仅用FLAIR序列。
每种均经预处理与侵蚀研究优化,技术1因多模态多样性及避免分割误差传播而表现最佳。
采用混淆矩阵衍生的标准指标:准确率、精确度、召回率、特异性及F1分数(表3)。科恩卡帕分数达0.99875,表明模型预测与真实标签几乎完全一致,远超随机水平,具备临床部署可靠性。
使用BraTS2018(278样本)和BraTS2019(335样本)数据集,含NIfTI格式的3D MRI图像(240×240×155),每样本包括四种模态图像及一例ROI标注。合并后共469 HGG和144 LGG样本,均衡选取140例(70/70)用于训练与测试(图9)。
剔除无诊断信息的切片(0-40和121-155),仅保留41-120切片;移除零值图像以聚焦有效特征。归一化与尺寸调整后,技术1输入尺寸为248×248×3,技术2为310×248×3,技术3保持192×192×3(表5)。
三级技术中,技术1聚合多模态切片,技术2加入分割图,技术3仅用FLAIR。基础CNN含三层卷积(3×3核)、最大池化(2×2)及64神经元全连接层。经增量调整(如层数、核数、激活函数、批大小等),最终确定五卷积层、窄化滤波、ReLU激活、批大小2、二元交叉熵损失及Adam优化器为最优配置。技术1准确率最高(99.93%),图11显示20周期内准确率与损失趋势。
九级分层调优从卷积与池化(L1)至学习率(L9),每级筛选最佳参数组合(图12-13)。例如,L2筛选滤波尺寸,L5确认ReLU激活最优,L9选定0.001学习率。图14展示了各级准确率提升过程,最终方案(L9选项5)达99.93%准确率。
癌症病例增长使医生早期检测压力倍增,尤其缺乏专业放射科医师时。CNN可辅助临床专家快速、可靠、精准地规划肿瘤治疗,降低死亡率。HNMD-CNN在BraTS2018上99.93%的准确率(表7)超越现有方法(如Jabbar等人98.9%),归功于分层窄化策略的逐步优化。大初始滤波捕获全局特征,小后续滤波细化细节,契合人类感知机制:先定位再详查。
然而,BraTS数据集存在局限性:人口与扫描仪多样性不足、缺乏临床元数据(如遗传标记)及非胶质瘤异常,可能影响现实泛化性。尽管HNMD-CNN通过分层滤波、丢弃正则化等对噪声具鲁棒性,严重退化图像仍需去噪预处理。未来需多中心异构数据验证。
3D成像设备仅在发达国家普及,昂贵进口替代方案是仿真检测。低质MRI可使诊断困难,导致重扫描。建议开发MRI硬件附件智能检测肿瘤,降低成本与时间,减轻患者压力。未来研究可探索多模态成像融合(如PET-MRI)、迁移与联邦学习以构建全球适用模型,同时整合分子标志物(如IDH突变、1p/19q共缺失)实现多维肿瘤刻画。联邦学习能跨机构训练而不共享原始数据,符合GDPR/HIPAA,提升泛化与安全。分层窄化方法具模态无关性,可扩展至乳腺癌、肝癌等局部异常病变检测。
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