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弱监督学习框架TCRBagger:基于TCR组装的个性化新抗原预测突破
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年09月24日 来源:Cell Systems 7.7
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来自Gao团队的研究人员针对新抗原免疫原性预测中忽略患者特异性TCR谱的瓶颈,开发了弱监督学习框架TCRBagger。该研究通过整合自监督学习、去噪学习和多示例学习策略,显著提升肽-TCR结合预测精度,为个性化肿瘤免疫治疗提供新方法。
科学家们开发出名为TCRBagger的创新弱监督学习框架,通过整合患者特异性T细胞受体(TCR)谱数据,显著提升个性化新抗原鉴定能力。该框架巧妙融合三种机器学习策略——自监督学习、去噪学习和多示例学习(MIL),有效模拟肽段与TCR之间的相互作用机制。
传统方法多局限于分析肽段特性、人类白细胞抗原(HLA)结合亲和力或单一肽-MHC-TCR(pMHC-TCR)相互作用,而TCRBagger突破性地将个体化TCR谱纳入免疫原性评估体系。该系统通过样本特异性TCR谱的组装(bagging)技术,在多个基准测试中展现出超越现有工具的预测性能,尤其在黑色素瘤免疫检查点阻断(ICB)治疗反应预测方面展现巨大潜力。
这项研究为肿瘤免疫治疗提供了前所未有的技术视角,通过建模肽段与患者特异性TCR谱的相互作用,为个性化新抗原鉴定开辟了新途径,最终有望推动精准免疫治疗的发展。
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