基于口腔癌数据库数据富集确定CD276靶点用于腭部黏液表皮样癌免疫治疗的研究

本文通过整合多组口腔癌数据库(GEO)进行生物信息学分析，筛选出744个差异表达基因，并富集鉴定CD276作为腭部黏液表皮样癌(PMEC)免疫治疗新靶点。研究结合体外细胞模型、原代细胞及类器官实验，证实CD276-CAR-NK细胞对PMEC具有显著杀伤效力，为罕见肿瘤的靶点发现提供了"数据库富集+多模型验证"的新范式。

　　

Highlight

生物信息学数据来源与富集

RNA测序数据来源于口腔癌相关矩阵数据库GSE59702、GSE153230、GSE262344和GSE36282（收录于NCBI GEO数据库），分别包含48、137、10和28个样本。GSE59702数据集包含24个唾液腺癌（SGC）肿瘤组织和24个匹配正常组织；GSE153230包含30个腺样囊性癌（ACC）肿瘤组织和107个正常组织；GSE262344包含5个黏液表皮样癌（MC）肿瘤组织（后续略）

实时细胞分析（RTCA）

采用xCELLigence RTCA仪器（RTCA S16，Agilent）以非侵入方式评估CAR-NK细胞对人PMEC的杀伤效率。首先将含10%胎牛血清（FBS）的完全培养基以50μL/孔加入E-Plate 16板计算背景阻抗，随后每孔加入100μL密度为1×10⁵ cells/mL的PMEC细胞悬液（后续略）

临床信息

两名PMEC患者的临床信息列于表1。均为硬腭中分化黏液表皮样癌，肿瘤尺寸分别为2.8×2×1.5(cm)和4.5×3×1.5(cm)。患者均接受手术联合局部放疗治疗，未发现颈部淋巴结转移。

基因数据富集

从GSE59702、GSE153230和GSE262344数据库分析获得差异表达基因（DEGs）（图1A），分别筛选出8787、9716和8442个DEGs（后续略）

讨论

传统癌症靶点发现通常基于文献检索或大量样本收集。然而对于PMEC等罕见癌症，短期难以收集足够样本（Mathew等2017）。由于缺乏大规模样本数据库和系统研究，许多PMEC散发病例仅能以个案报告形式披露（Baumgardt 2014; Martins 2016等）。本研究通过整合口腔癌大类数据库，成功突破PMEC独立数据库缺失的限制，证明跨病种数据富集策略对罕见癌种研究的可行性。CD276作为免疫检查点分子，在多种实体瘤中高表达而与正常组织低表达的特征，使其成为理想免疫治疗靶点。通过多模型验证体系（细胞系/原代细胞/类器官），首次证实CD276-CAR-NK对PMEC的特异性杀伤能力，为罕见肿瘤治疗提供可推广的研究范式。

结论

本研究提供新思路：针对PMEC等罕见癌症的免疫治疗靶点，可通过其上级类别（口腔癌）的数据富集进行确定。更重要的是，数据库分析与实验室多模型验证相结合的方法，可使靶点蛋白选择更加精准。