FN1基因错义突变rs137854486 (W1925R)在甲状腺乳头状癌中的风险破译：计算生物学与分子动力学研究

本综述通过整合多组学数据（GSE138198、GSE58689、GSE6339）鉴定出73个PTC（甲状腺乳头状癌）关键差异表达基因（DEGs），聚焦FN1（纤连蛋白1）作为核心枢纽基因。通过生存分析、免疫浸润及分子动力学模拟（RMSD/RMSF/Rg）证实其错义突变W1925R（ΔΔG=9.85646）通过破坏蛋白稳定性促进PTC肿瘤发生，为靶向治疗提供新视角。

　　

Section snippets

Microarray dataset

转录组数据源自基因表达综合数据库（GEO）。研究采用三个人类PTC（甲状腺乳头状癌）基因表达数据集：人类（GSE138198）、转基因小鼠（GSE58689）和细胞系（GSE6339），均基于GPL570平台（Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0阵列）进行疾病组与正常组的对比分析。

Survival analysis

利用GEPIA2（基因表达谱交互分析2.0）探究枢纽基因表达与PTC预后的关联。筛选P值<0.05的基因作为甲状腺癌分化和识别的关键指标。

Immune infiltration analysis

免疫浸润分析可揭示免疫细胞与肿瘤的互作机制及其临床结局。不同癌症类型的免疫浸润特性存在显著差异……

Results

人类数据集GSE138198共识别4552个DEGs（差异表达基因），其中2681个上调、1871个下调。转基因小鼠数据集GSE58689包含5571个DEGs（1761上调/3810下调）。细胞系数据集GSE6339显示468个DEGs（276上调/192下调）。三数据集共筛选出73个共同DEGs（附表1）。DEGs的通路富集分析显示……

Discussion

甲状腺乳头状癌（PTC）较其他甲状腺癌预后更佳。早期PTC生长缓慢，经适当治疗可治愈。本研究针对PTC相关DEGs进行了通路富集、枢纽基因鉴定与分析，发现7条显著通路：结直肠癌、黏着斑、乙型肝炎、人乳头瘤病毒感染、癌症通路、前列腺癌及甲状腺激素信号通路。其中结直肠癌……

Conclusion

本研究最终确定73个PTC显著DEGs富集于7条共同通路。FN1被鉴定为PTC中高度互联模块的核心枢纽基因。生存分析、免疫浸润及共表达分析均证实FN1与PTC预后相关。V692E、T817A、T817P和W1925R是FN1中与PTC相关的单核苷酸变异（SNVs），其中W1925R突变体被证实具有最强 destabilizing 效应和功能性影响。