伤寒沙门氏菌新型嵌合蛋白疫苗的计算机设计与评估：一种靶向SteD、FliC和STIV抗原的多表位免疫原策略

本综述系统介绍了针对伤寒沙门氏菌（S. Typhi）的新型多蛋白嵌合疫苗（SOF）的计算机辅助设计策略。研究通过整合SteD（免疫逃逸效应蛋白）、FliC-D1（TLR-5激动结构域）和STIV（侵袭黏附蛋白）三种关键抗原，采用刚性(EAAAK)3 linker连接，经免疫信息学与分子模拟验证其高抗原性（VaxiJen: 0.9228）、结构稳定性（RMSD/RMSF）、非过敏特性（AlgPred）及与TLR-4/5的强结合力，为开发高效伤寒疫苗提供了新范式。

　　

Section snippets

Antigen selection

嵌合疫苗设计策略性地整合了三种伤寒沙门氏菌抗原：SteD、FliC和STIV，因其在致病机制和免疫激活中的互补作用而被选中。这些蛋白质的氨基酸序列从UniProt数据库（https://www.uniprot.org/）获取（登录号：Flagellin为Q56086，SteD为Q8Z453，STIV为Q8Z3Y8）。这三种抗原因其在致病和免疫中的互补作用而被选中。

Vaccine candidate construct design and assembly

嵌合SOF疫苗通过将SteD、STIV和FliC-D1抗原与(EAAAK)?刚性连接子串联而成功构建，以确保结构域独立性。对最终576个氨基酸构建体的计算分析证实了其稳定架构，所有关键功能基序（包括SteD的免疫逃逸结构域、FliC的TLR5结合环和STIV的黏附序列）均位于适合免疫识别的溶剂暴露方向。

Discussion

本研究提出了SOF——一种针对伤寒沙门氏菌的新型多抗原嵌合疫苗的计算机设计与验证。通过整合三种关键毒力因子（SteD、STIV和FliC-D1），我们设计了一种单一免疫原，旨在破坏关键致病过程：免疫逃逸、黏膜侵袭和先天免疫激活。我们的系统计算分析证实，SOF构建体满足有效疫苗候选物的基本标准，表现出……

Conclusion

总之，我们通过整合三种关键抗原，设计了SOF——一种针对伤寒沙门氏菌的新型多表位嵌合疫苗候选物，以克服现有疫苗的局限性。全面的计算机分析证实了其结构稳定性、强大的预测免疫原性和优异的安全性。SOF候选物代表了一种有前景、经济高效的策略，可用于开发持久且具有广泛保护性的伤寒疫苗。其设计直接符合WHO……

CRediT authorship contribution statement

Mohsen Bidar Ajerloo： 原始草稿撰写、验证、软件、调查、形式分析、数据管理。Abbas Hajizade： 评审编辑、原始草稿撰写、验证、项目管理、方法论、概念化。Shahram Nazarian： 验证、方法论、概念化。Kavyan Khalili： 可视化、验证、软件。

Declaration of competing interest

作者声明不存在任何可能影响本研究报告的已知竞争性财务利益或个人关系。