Piperlongumine（PIP）通过调控枢纽基因抑制结直肠癌的整合计算与实验验证研究

本研究通过整合生物信息学分析与实验验证，首次系统阐明天然化合物Piperlongumine（PIP）在结直肠癌（CRC）中通过调控TP53、CCND1、AKT1等枢纽基因发挥抗癌作用的机制。研究结合多组学数据筛选、分子对接、ADMET（药物代谢动力学）预测及体外实验（IC50为3-4 μM），证实PIP具有抑制迁移、促进凋亡和调控信号通路的潜力，为天然产物抗CRC治疗提供了新策略。

　　

Section snippets

Dataset mining and DEG identification

本研究从基因表达综合数据库（GEO）获取了三个独立的CRC转录组数据集（GSE33113、GSE49355和GSE200427），筛选标准包括：（1）包含肿瘤与匹配正常对照样本；（2）与CRC相关；（3）平台多样性以增强结果稳健性（两个微阵列数据集——GSE33113等）。

Identification of potential DEGs and their screening through multiple databases

基因筛选是生物信息学分析的关键第一步，为理解多种生物学背景下的基因表达提供基础。本研究通过GEO2R对数据集进行标准化，以绝对log |FC| > 1和P值 < 0.05为阈值，识别肿瘤与正常样本间的差异表达基因（DEGs）。

Discussion

CRC仍是全球癌症相关发病和死亡的主要原因。尽管诊断和治疗策略有所进展，但延迟检测和治疗耐药持续影响临床预后。近年来，整合生物信息学与计算研究已证明在识别CRC关键分子标志物和治疗候选物方面具有成效。本研究通过多维度方法系统评估了PIP的作用。

Conclusion

总之，本研究首次通过整合多数据集转录组学、枢纽基因优先排序、分子对接、ADMET分析及体外实验，全面验证了PIP在结直肠癌中的基因水平作用。结果表明，PIP通过上调TP53和下调CCND1、AKT1、CTNNB1及IL1B，靶向关键CRC相关通路，导致剂量依赖性细胞毒性、迁移抑制、凋亡诱导和基因表达调控，凸显其作为CRC治疗剂的潜力。