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抑制甘油-3-磷酸磷酸酶与增强甘油-3-磷酸穿梭通量对快速生长产油Schizochytrium高效脂肪酸生产的关键作用
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年09月25日 来源:Advanced Science 14.1
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本综述系统阐述了通过抑制甘油-3-磷酸磷酸酶(G3PP)活性与增强甘油-3-磷酸(G3P)穿梭通量,显著提升裂殖壶菌(Schizochytrium)脂肪酸合成效率的分子机制与工程策略,为微生物油脂工业化生产提供了突破性解决方案。
脂肪酸作为可持续生物燃料和高价值营养补充剂(如ω-3多不饱和脂肪酸),在能源与健康领域具有重要应用。尽管微生物脂肪酸生产已取得显著进展,但低效价和低生产率仍是限制其工业化应用的关键瓶颈。异养微藻裂殖壶菌(Schizochytrium)因其快速生长、高效碳源同化和高脂质积累能力而成为理想底盘细胞。本研究通过多组学分析和定向工程改造,揭示了调控脂肪酸合成的关键机制,并构建了高效生产菌株。
在5-L发酵罐中采用补料分批培养策略,ZW1菌株在68小时达到最大生物量92.18 ± 2.01 g L?1,总脂肪酸(TFA)和甘油三酯(TAG)效价分别为41.15 ± 1.58 g L?1和38.40 ± 3.92 g L?1,生产率分别为0.61 ± 0.02 g L?1 h?1和0.56 ± 0.06 g L?1 h?1。该菌株展现出快速生长和高葡萄糖消耗能力,但其脂肪酸效价和生产率仍低于其他高产油微生物(如耶氏酵母和红酵母)。
为克服裂殖壶菌遗传工具缺乏的限制,研究采用常压室温等离子体(ARTP)诱变结合荧光激活细胞分选(FACS)策略进行定向进化。针对细胞聚集和染色效率低的问题,通过安装微型电机促进细胞解聚,并设计多步门控策略(P1: 全群体;P2: 完整单细胞;P3: 非聚集亚群;P4: 前1%荧光细胞)。经过六轮筛选,获得突变株ZW2,其生物量、TFA和TAG含量均显著提升。在摇瓶培养中,ZW2在60小时的TFA和TAG含量分别达到66.37%和54.38%,较ZW1提高1.40和1.43倍。在5-L发酵罐中,ZW2的生物量、TFA效价和生产率为111.78 ± 1.46 g L?1、72.14 ± 1.38 g L?1和1.06 ± 0.02 g L?1 h?1,较ZW1均有显著提升。
通过基因组重测序、转录组学和代谢组学分析,发现ZW2中甘油-3-磷酸磷酸酶(G3PP)活性抑制和多不饱和脂肪酸合酶C亚基(ORFC)突变是关键遗传变异。分子对接和分子动力学模拟表明,G3PP第147位点突变(甘氨酸→天冬氨酸)引入了新的氢键,降低了结合能和分子间能,导致酶活性下降。酶活实验证实ZW2的G3PP活性显著低于ZW1,而甘油激酶活性上调,促进了甘油-3-磷酸(G3P)积累。此外,ORFC第273位点突变(异亮氨酸→缬氨酸)增强了多不饱和脂肪酸(PUFA)合成,在大肠杆菌异源表达体系中DHA和DPA含量提高1.77倍。
转录组分析显示,ZW2中脂肪酸合成(乙酰辅酶A羧化酶、脂肪酸合酶)、G3P穿梭(甘油-3-磷酸脱氢酶GPD1/GPD2)和TAG合成(磷脂酸磷酸酶)相关基因显著上调,而部分脂质降解基因下调。代谢组学进一步证实糖酵解中间体(F6P、PEP、GAP)、G3P穿梭代谢物(DHAP、G3P)和脂肪酸前体(乙酰辅酶A)水平升高,表明中心碳代谢和脂质合成通量增强。
基于G3P穿梭通量增加和G3P降解抑制的机制,研究在ZW1中共过表达gpd1和gpd2基因(菌株ZW1 G1G2-1),并添加G3PP抑制剂CP1。该组合策略使TFA效价和生产率达到ZW2的80%,验证了G3P穿梭调控的核心作用。发酵性能显示,ZW1 G1G2-1的TFA效价和生产率分别为52.01 ± 1.11 g L?1和0.76 ± 0.02 g L?1 h?1,较ZW1显著提升。
在ZW2背景中过表达TAG合成关键基因二酰甘油酰转移酶(dgat)和长链酰基辅酶A合成酶(lcas),获得工程菌ZW2-D-L2。在5-L发酵罐中,该菌株生物量达122.64 ± 5.05 g L?1,TFA和TAG效价分别为94.65 ± 1.29 g L?1和88.51 ± 5.38 g L?1,生产率分别为1.39 ± 0.02 g L?1 h?1和1.30 ± 0.08 g L?1 h?1,较ZW1提高2.30倍和2.32倍。BODIPY染色显示ZW2-D-L2细胞中脂滴几乎充满整个细胞,细胞尺寸显著增大。稳定性测试表明该菌株遗传和表型性状稳定,具备工业化应用潜力。
本研究通过整合发酵优化、随机诱变、高通量筛选和多组学分析,建立了高效的裂殖壶菌工程平台。关键发现包括:
G3PP活性抑制通过减少G3P水解,增强TAG合成前体供应;
G3P穿梭通量增加协调了细胞生长和脂质合成的碳流分配;
ORFC突变提升了PUFA合成效率。
与传统策略(如耶氏酵母的氧化还原工程)相比,该研究提供了针对碳中心代谢的新调控视角。经济性分析表明,ZW2-D-L2的脂肪酸生产成本较其他底盘微生物降低10.79–16.95%,且生产周期缩短16–28小时,具备显著工业化优势。
本研究开发了高效产油裂殖壶菌菌株ZW2-D-L2,其TFA和TAG效价分别达94.65 g L?1和88.51 g L?1,生产率分别为1.39 g L?1 h?1和1.30 g L?1 h?1,性能超越已报道所有微生物系统。研究揭示了G3P代谢调控的核心作用,建立了“菌株优化-机制解析-遗传工程”的研究范式,为微藻生物技术产业化提供了突破性解决方案。
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