利用表型组学技术解析玉米时间动态生长模式的基因组学洞察

【字体: 时间:2025年09月25日 来源:Euphytica 1.7

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  本研究利用无人机系统(UAS)监测三个重组自交系群体在灌溉/非灌溉条件下10个时间点的株高动态变化(TPHT),通过Weibull模型拟合生长曲线并计算株高生长速率(PHGR),发现PHGR相较于TPHT更能稳定反映不同水分条件下的表型差异,并鉴定到与干旱响应相关的关键基因(如mads69)及SNP位点(chr1_274716256),为作物适应性育种提供了精准基因组预测新策略。

  

通过无人机系统(UAS/UAV)采集三个重组自交系(RILs)群体在灌溉与非灌溉条件下10个时间点(43–133天)的株高时序数据(TPHT),研究发现遗传方差随生育期波动导致遗传力在0.42–0.84间变化。利用Weibull模型拟合生长曲线,以拐点计算株高生长速率(PHGR)——一个与玉米源强度相关的量化性状。PHGR在三种RIL群体中均显著区分不同水分条件,而TPHT的表型差异有限。在非灌溉条件下,LH82/LAMA群体中发现PHGR相关显著SNP(chr1274716256),该位点位于染色体1上260–280 kb的强连锁不平衡(LD)区块内,毗邻d8、kn1、knox3、phy1等候选基因。TPHT在不同时间点下检测到多个显著位点,涉及toc1、elm1、an1、cct1、vp8等生长调控基因。值得注意的是,利用开花前连续TPHT计算的生长速率数据在非灌溉条件下发现开花激活基因mads69,提示其抗旱潜能。基因组预测显示TPHT的预测精度在灌溉条件下更高且随生育期提升,而PHGR表现出更稳定的跨时间点预测能力(范围0.11–0.55)。基因组标记的时效性在灌溉环境中稳定,在非灌溉环境中波动显著。这些发现为作物育种提供了时序性状分析的基因组学新视角。

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