符号发生行动：从生物分子视角重新审视遗传编码中的符号生成机制

本综述从生物分子层面创新性地探讨了遗传编码（GC）中的符号学关系，提出了符号生成（semiopoiesis）是信息控制系统的内在属性这一突破性观点。作者通过解构基因表达（DNA→mRNA→tRNA）各阶段的符号化进程，揭示了从超文本（hypertext）到三元符号（tRNA为载体）的渐进式符号生成机制，为生命科学的信息传递研究提供了新的范式转换。

　　

章节精选

回顾历史以求新知

我们旨在重新审视罗曼·雅各布森60年前提出的问题，结合此后重大科学进展，推动研究从单纯借用语言学概念转向阐明生物分子信息过程中符号生成（semiosis）的基础机制。特别关注符号生成在遗传信息传递中的本质作用。

符号生成与符号结构

我们将符号生成理解为符号的形成过程——即在特定系统和语境中建立"所指"与"能指"的复杂关系。初步定义可参考皮尔士的经典表述（虽未明确提及语境、系统及主体性）：

"符号生成是一种包含三个主体协作的行为或影响，即符号、对象及其解释项"

核苷酸作为最小编码单元

语言抽象系统与言语物质表现的区别，堪比完整核苷酸与其符号化缩影（仅保留碳环数量和氢键数两个差异特征）的对比。这体现了符号实体分化的通用机制：

"应用于单元的双重对立原则是符号系统的基本构成方式"

基因表达的渐进式符号生成

鉴于问题复杂性，我们聚焦DNA编码区的基因表达过程。该过程分为三个具有独特符号学特征的阶段，可视为从超文本（基因组作为文本集合）向单一文本（基因）再向符号（tRNA）的转化历程⁵。

翻译作为符号生成与密码创建

若将基因表达视为符号化过程的物质体现，则可揭示符号关系的形成机制——即所指与能指连接的建立。前述三种符号学理论（索绪尔二元论、皮尔士三元论、弗雷格三重性）分别适用于不同阶段：索绪尔模型对应转录过程，皮尔士对话模型体现核糖体介入的翻译初期，而最终tRNA则完美诠释了弗雷格的三元符号结构（符号载体-意义-指称）。

结论

基因表达全过程呈现多种符号生成形式：从索绪尔式二元结构，演进至皮尔士对话模型，最终实现弗雷格式三元关系。这一发现尤具启发性，可与尤里·洛特曼的文本理论形成对话——不是符号生成文本，而是文本生成符号。