利用三种分子条形码对阿斯彭公园地区常见植物物种进行比较鉴定

《Canadian Journal of Plant Science》：Comparative identification of common Aspen Parkland plant species using three molecular barcodes

本研究评估了trnL、rbcL和matK三个叶绿体条形码在阿尔伯塔省杨树草甸区共存的14种植物物种中的识别效果。最大似然分析显示，matK家族内遗传距离最高但缺乏通用引物，rbcL扩增容易但鉴别能力低，而trnL在物种鉴别中表现最佳，其短片段适合粪便样本中降解DNA的下一代测序。

　　

摘要

本研究评估了三种叶绿体条形码（trnL、rbcL和matK）在识别阿尔伯塔省白杨公园地区六种常见植物科的14种共存植物物种方面的有效性。最大似然系统发育分析和遗传距离分析表明，matK在科内表现出最高的遗传差异，但缺乏通用引物。虽然rbcL易于扩增，但其区分能力较低。相比之下，trnL在科内物种区分方面表现更优，并且其扩增片段较短，这使其适用于对食草动物粪便样本中降解的植物DNA进行下一代测序。