PCOS与T2DM共享衰老相关基因网络的发现:生物标志物鉴定与功能验证
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时间:2025年09月26日
来源:Frontiers in Endocrinology 4.6
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本综述系统揭示了多囊卵巢综合征(PCOS)与2型糖尿病(T2DM)在衰老相关基因网络层面的共病机制,通过生物信息学挖掘与实验验证发现TUBA4A、RTN1、G6PD、HP四个核心基因通过内质网应激(ER stress)、氧化还原稳态和免疫浸润等通路协同驱动疾病进展,为基于细胞衰老(cellular senescence)机制的精准诊疗提供新靶点。
多囊卵巢综合征(PCOS)和2型糖尿病(T2DM)是两种全球高发的内分泌代谢性疾病,存在显著的共病现象。近年研究表明,细胞衰老(cellular senescence)可能是连接这两种疾病的核心病理环节。衰老细胞通过衰老相关分泌表型(SASP)释放炎症因子,诱发慢性低度炎症,进而加速疾病进展。然而,两者在分子网络层面的关联机制尚未系统阐明。
研究团队从GEO数据库获取PCOS(GSE54248)和T2DM(GSE23561)的转录组数据,通过limma包筛选差异表达基因(DEGs)。将DEGs与衰老相关基因(ARDEGs)取交集后,利用STRING数据库构建蛋白质相互作用(PPI)网络,并通过CytoHubba插件鉴定枢纽基因。采用CIBERSORT算法分析免疫细胞浸润特征,通过基因集富集分析(GSEA)探索基因功能,最后通过qRT–PCR在临床样本中验证候选基因表达。
共鉴定出80个PCOS与T2DM共有的DEGs,其中15个为衰老相关差异表达基因(ARDEGs)。GO和KEGG分析显示这些基因显著富集于炎症反应、免疫调节、钙信号通路和碳水化合物代谢等过程。进一步筛选出4个核心枢纽基因:TUBA4A、RTN1、G6PD和HP。qRT–PCR实验证实,这四个基因在PCOS和T2DM患者外周血中均显著高表达。ROC曲线分析显示它们对两种疾病均具有优异诊断价值(AUC均>0.8)。
TUBA4A作为微管稳定性调节因子,在卵母细胞减数分裂和胚胎发育中起关键作用,其突变可能导致不孕与胚胎发育停滞,并与年龄依赖性表达增强相关。RTN1作为内质网应激(ER stress)调控因子,通过激活未折叠蛋白反应(UPR)途径诱导细胞衰老和纤维化。G6PD作为磷酸戊糖途径(PPP)关键酶,调控NADPH水平并影响氧化还原稳态,其功能异常与糖尿病风险和细胞衰老密切相关。HP作为血红蛋白清除蛋白,通过调节氧化应激与炎症反应参与PCOS和T2DM的病理过程。
功能富集分析提示,RTN1显著参与丁酸盐代谢通路,G6PD与内质网-高尔基体囊泡运输密切相关,HP则涉及核苷酸转移酶活性调节。免疫浸润分析发现,TUBA4A和HP与M0型巨噬细胞呈负相关,TUBA4A与静息树突状细胞和肥大细胞正相关,HP与M2型巨噬细胞正相关,表明这些基因可能通过调节免疫细胞功能参与疾病发生。
单细胞转录组分析进一步揭示,TUBA4A在血小板中高表达,RTN1特异性表达于单核细胞,G6PD在单核细胞和NK细胞中双重阳性表达,凸显了其细胞类型特异性调控网络。
本研究首次系统揭示PCOS与T2DM共享的衰老相关分子网络,鉴定出TUBA4A、RTN1、G6PD、HP四个具有跨组织诊断价值的核心基因。它们通过调控ER应激、氧化还原平衡、免疫微环境等机制共同驱动细胞衰老与疾病进展,为开发基于衰老机制的联合诊疗策略提供了新靶点与理论依据。
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