泰国首次发现大鼠源Rocahepevirus ratti（HEV-C）外溢至人类的证据及其系统进化与临床意义研究

本文首次报道了泰国一例心脏移植术后患者感染大鼠肝炎病毒（Rocahepevirus ratti, HEV-C）并发展为慢性肝炎及肝硬化的临床案例。研究通过宏基因组测序（mNGS）与靶向富集技术（CVRPte）组装出完整病毒基因组，结合系统进化分析（PCA）揭示其与东南亚鼠源毒株的同源性，证实人类为偶然宿主。该发现凸显了HEV-C（rHEV）在免疫抑制人群中的致病潜力，强调开发特异性诊断工具以监测人兽共患传播风险的必要性。

　　

1. 引言

急性甲型（HAV）与戊型肝炎病毒（HEV）感染是全球疾病负担的重要来源，每年分别引起150万与2000万病例。感染人类的HEV毒株多属Paslahepevirus balayani（HEV-A），其8个基因型中1–2型通过粪-口途径传播，3–4型则与接触感染动物（如猪）或食用未煮熟肉类相关。Hepeviridae家族还包括禽类（Avihepevirus）、大鼠（Rocahepevirus, rHEV）及蝙蝠（Chirohepevirus）特异性病毒属。Rocahepevirus于2010年在德国大鼠中首次发现，随后在全球鼠类中检出，近年亦在人类中报道，尤其集中于免疫抑制个体。2018年香港首例肝移植患者慢性肝炎病例中检出rHEV，此后亚洲报道了76%的人类感染与71%的鼠类序列。实验表明，人类粪便中的病毒复制受限，而鼠肝匀浆源病毒可在人肝细胞系中有效复制，证实其明确的人兽共患潜力。

2. 材料与方法

研究回顾性分析泰国不明原因急性发热（AFI）患者队列，经伦理批准（COA Si.391/2021）收集血清样本。患者09869为发热伴不明肝炎病因的病例。样本经Benzonase处理去除宿主核酸后，使用KingFisher Apex提取核酸，通过SuperScriptIV与Sequenase v2.0合成宏基因组cDNA文库，Illumina Nextera XT v2建库后由Azenta测序。为富集病毒序列，使用Twist Biosciences的全面病毒研究面板（CVRP）覆盖3153种病毒参考序列。数据经DiVir 3.0流程处理，去除低质量与人类序列。通过RT-PCR与SMART-PCR填补基因组缺口，并使用Sanger测序与MiSeq测序验证。系统进化分析检索Hepeviridae家族序列，经MAFFT v.7.487比对后，采用IQ-TREE v.2.1.3构建最大似然树。主成分分析（PCA）基于Tamura-Nei模型计算核苷酸分歧，使用PCO软件与Bray-Curtis相异度评估宿主关联性。

3. 结果

在泰国AFI患者筛查中，通过NGS在患者09869中检出rHEV。经mNGS与teNGS分别获得593X与1221X测序深度，结合SMART-PCR与Sanger测序组装出6995 nt近全长基因组（登录号PX021458）。与其他人源rHEV毒株相比，Ma617-09869全基因组一致性约80%，其中ORF1的宏区+PRR区（nt 2400–2700）为高变区。患者为65岁男性，心脏移植后2个月出现肝功能异常，虽停用疑似肝损伤药物（如itraconazole与simvastatin），仍进展为慢性活动性肝炎与肝硬化，最终因心律失常死亡。其免疫抑制状态、慢性肝炎进程及缺乏其他病毒病因支持rHEV感染的可能性。

系统进化分析显示，Ma617-09869属于Rocahepevirus ratti基因型C1，与老挝、泰国、印尼、柬埔寨及越南的鼠源毒株聚为一支，为中国毒株所在分支之外的新簇。PCA表明，白腹鼠（Niviventer spp.）为原始宿主，黑鼠与常见鼠（Rattus spp.）为天然储主，人类与鼩鼱等为偶然宿主。病毒尚未显示人际传播适应性，感染结局取决于宿主免疫状态。

4. 讨论

Rocahepevirus是一种新兴人兽共患病，目前罕见且主要影响免疫抑制个体。泰国首例人感染病例表现为心脏移植后急性肝炎至肝硬化的进程，与香港、西班牙报道的移植相关感染类似。血清阳性率研究显示，免疫抑制人群感染风险略高（1.2%），无家可归与注射吸毒者中达4.9%。鼠类携带率高达14.7%–41.2%，且病毒在猪中检出提示家畜作为中间宿主的潜在风险。基因组分析表明，东南亚鼠源毒株多样性高，需开发特异性血清学与分子检测（如ORF2肽段EIA与RT-qPCR）以准确评估流行率。当前传播模式以鼠-人溢出为主，但病毒演化可能增强适应性与传播力，需持续监测以防公共卫生威胁。

利益冲突与资助

作者声明Abbott Laboratories未参与研究设计、数据分析与论文撰写，部分作者为Abbott员工或受其资助。研究由Abbott大流行防御联盟计划支持。