茄科青枯病菌复合体的系统发育多样性与克隆扩张:基于茄子细菌性枯萎病爆发的案例研究
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时间:2025年09月26日
来源:Plant Pathology 2.4
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来自印度的研究人员针对茄科作物细菌性枯萎病的病原多样性问题,开展了对Ralstonia solanacearum物种复合体(RSSC)的遗传特征研究。通过多基因位点序列分型(MLST)和系统发育分析,揭示了Phylotype I的高克隆稳定性与区域性适应特征,为病害防控策略提供了关键进化生物学依据。
茄科青枯病菌物种复合体(Ralstonia solanacearum species complex, RSSC)是引起茄科蔬菜细菌性枯萎病的重要病原菌。本研究采用多相分类方法对印度泰米尔纳德邦患病茄子和番茄植株中分离的9个菌株进行鉴定。所有菌株接种3–4天后均导致测试植株完全萎蔫,显示强致病性。通过16S rRNA测序和物种特异性引物鉴定为R. pseudosolanacearum,多重PCR将其归类为Phylotype I。
对5个看家基因(adk, gapA, gyrB, ppsA, gdhA)和2个毒力基因(egl, fliC)进行多基因位点序列分型(MLST),发现高度遗传保守性:多数菌株等位基因完全一致,仅在ppsA和egl基因中发现3个菌株存在新等位基因变异。MLST聚类形成6个群组,其中Cluster I呈现高度相似性,Cluster III和IV则显示等位基因多样性。
跨四大Phylotype的系统发育分析表明:Phylotype I具有中度遗传多样性,反映遗传稳定但克隆多样的种群特征;Phylotype II表现出稍高的核苷酸多样性但单倍型多样性降低,提示种群收缩或选择压力;Phylotype III虽仅含5个菌株却显示最高核苷酸多样性及频繁重组事件,表明进化活跃谱系;Phylotype IV呈现中等多样性且重组事件较少,预示更稳定的种群结构。该研究揭示了RSSC菌株的克隆结构、地域适应性及进化模式,强调持续基因组监测对制定病害防控策略的重要性。
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