《European Journal of Surgical Oncology》：Current Status and Clinical Usefulness of Genomic Panel Testing Using PleSSision-160 in Resectable Esophageal Squamous Cell Carcinoma
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食管鳞癌术后生存及化疗抵抗与PleSSision-160基因面板分析相关性的研究。该研究对61例患者66份ESCC样本进行PleSSision-160检测，发现TP53突变占比最高（80.4%），高拷贝数异常（≥30）与5年总体生存率（p=0.019）及无复发生存率（p=0.077）显著相关，微创手术和pStage≥III是独立预后因素。首次证实该基因面板对术后生存和化疗抵抗评估的临床价值。
Kazuaki Matsui|Hirofumi Kawakubo|Satoru Matsuda|Eriko Aimono|Kohei Nakamura|Kazumasa Fukuda|Rieko Nakamura|Hiroshi Nishihara|Yuko Kitagawa
东京都新宿区品川町35-banchi，庆应义塾大学医学院外科
摘要
引言
基于基因组测序的治疗方法在食管癌治疗中的临床重要性日益增加。本研究旨在明确使用PleSSision-160基因组检测面板对可切除食管鳞状细胞癌（ESCC）的现状及其临床应用价值。
材料与方法
来自61名ESCC患者的66份肿瘤组织样本接受了PleSSision-160检测，其中包括46份前瞻性收集的手术样本和20份新辅助化疗前回顾性收集的活检样本。研究探讨了突变谱与长期生存率和化疗耐药性之间的关联。
结果
通过PleSSision-160检测，在手术样本中发现的五大主要突变依次为TP53（80.4%）、KMT2D（13.0%）、NOTCH1（13.0%）、EP300（8.7%）和AMER1（8.7%）。虽然单个突变与长期生存率无显著关联，但具有高拷贝数改变（CNA）状态（≥30个拷贝）的患者，其5年总生存率（OS）和无复发生存率（RFS）低于CNA状态较低的患者（OS和RFS的p值分别为0.019和0.077）。多变量分析显示，微创手术、p分期≥III以及高CNA状态是影响5年OS和RFS的独立因素。
结论
本研究首次利用PleSSision-160基因组检测面板探讨了可切除ESCC患者的术后生存率和化疗耐药性。研究结果表明，高CNA状态是影响长期生存的风险因素。与以往的ESCC基因组测序研究相比，使用PleSSision-160似乎是一种有前景的方法。
引言
食管癌（EC）是全球第七大癌症相关死亡原因[1]。尽管包括根治性手术、放疗和化疗在内的多学科治疗方法有所进展，但EC患者的预后仍较其他消化系统癌症差[2]。为应对这一挑战，对EC组织进行基因组分析已成为一个有前景的新方向。在两种主要组织类型的EC中，食管鳞状细胞癌（ESCC）在亚洲国家的发病率高于食管腺癌（EAC）[3]。我国已有多项研究报道了ESCC的全外显子测序结果。Sawada等人对144例ESCC患者的肿瘤和非肿瘤食管组织进行了全外显子测序[4]，建立了ESCC中发生基因和通路异常的数据库。此外，Booka等人研究了44例ESCC和8例EAC患者的基因组改变，以寻找潜在的分子靶点[5]。
虽然全外显子测序能够处理大量数据，但成本高昂且耗时较长。我们机构推出了针对多种癌症类型的PleSSision-160基因组检测项目。Saotome等人报道了PleSSision-160在恶性卵巢肿瘤中的临床应用价值[6]，发现40%的恶性卵巢肿瘤病例存在靶点基因。他们还强调了拷贝数改变（CNA）与癌症预后的关联。本研究旨在评估PleSSision-160多基因基因组检测面板在可切除ESCC中的现状及其临床应用价值。
患者群体
本研究使用PleSSision-160进行基因组检测，旨在探讨癌症基因突变与肿瘤特征之间的关联。样本来源于两种方式：一是食管切除术期间立即获取的手术标本；二是初次诊断时进行的内镜活检标本。
纳入患者
共有80份样本被纳入研究，其中57份来自手术标本，23份来自内镜活检标本，这些样本来自75名患者（见补充图）。在这些样本中，发现了5对同一患者的手术标本和活检标本的重复配对样本。排除标准包括：10份组织类型非鳞状细胞癌（SCC）的样本，以及1例因宫颈食管问题需行喉咽食管切除术的病例。
讨论
全球范围内，对EC基因组突变的研究已取得进展[5]、[14]、[15]，但其临床意义和实际应用仍不明确。需要进一步采用多种方法开展相关研究。据我们所知，这是首次基于基因组检测面板明确突变谱对根治性食管切除术后生存率和NAC药物耐药性影响的研究。
结论
总之，本研究揭示了使用PleSSision-160进行基因组检测在可切除ESCC中的现状及其临床应用价值。PleSSision-160在ESCC检测中表现出良好的质量和准确性，与之前的检测面板相当。研究结果表明，高CNA状态是影响根治性食管切除术后5年OS和RFS的风险因素。尽管单个突变与长期生存率或药物耐药性的关系尚不明确，但需要进一步研究以明确这些机制。
作者贡献
Kazuaki Matsui：概念构思、方法设计、数据管理、数据分析、撰写初稿。Hirofumi Kawakubo：概念构思、撰写、审稿与编辑。Satoru Matsuda：概念构思、数据分析、撰写、审稿与编辑。Kazumasa Fukuda：概念构思。Rieko Nakamura：概念构思。Yuko Kitagawa：概念构思、撰写、审稿与编辑。Eriko Aimono：方法设计、数据管理、验证、数据分析。Kohei Nakamura：方法设计。
利益冲突
Kazuaki Matsui、Hirofumi Kawakubo、Satoru Matsuda、Eriko Aimono、Kohei Nakamura、Kazumasa Fukuda、Rieko Nakamura、Hiroshi Nishihara和Yuko Kitagawa与本文内容无直接利益冲突。
致谢
作者感谢庆应义塾大学医学院外科的Kumiko Motooka在论文准备过程中提供的帮助。本研究得到了日本学术振兴会（JSPS KAKENHI）的资助（项目编号JP 23K08221）。
