OrthoXML工具集：面向直系同源数据操作的专业化集成解决方案

为解决OrthoXML格式缺乏标准化操作工具的问题，来自DessimozLab的研究人员开发了OrthoXML-tools工具集，支持对该格式文件的加载、处理与多格式导出，显著提升了直系同源数据（orthology data）的互操作性与分析效率，为进化基因组学研究提供关键技术支持。

　　

OrthoXML作为一种标准化文件格式，被广泛应用于直系同源（orthology）和旁系同源（paralogy）关系的数据存储，其结构既支持规范化描述进化关系，又允许用户嵌入自定义及数据库特异性数据。尽管多数直系同源数据库采用该格式进行数据导出，但长期以来缺乏一套完整工具集以支持相关操作。为此，研究团队推出OrthoXML-tools（访问链接：https://github.com/DessimozLab/orthoxml-tools），该工具集具备 OrthoXML 文件的读取、处理与多格式转换功能，并通过基准测试验证了其高效性能与广泛适用性。