具有抗弧菌潜力的咸水来源暹罗芽孢杆菌B03的表型、代谢组与基因组学特征解析

来自越南的研究人员针对水产养殖中弧菌(Vibrio)病原防控难题，首次对Lang Co Bay分离的暹罗芽孢杆菌(Bacillus siamensis) B03开展了多组学联合分析。研究发现该菌株具有广谱抗弧菌活性（抑菌圈14.7–22.3 mm），基因组揭示其携带bacillaene/fengycin/difficidin等抗菌物质合成基因簇（相似度78%-100%），代谢组鉴定出20种环二肽类化合物，为新型生物防治剂开发提供了理论基础。

　　

本研究首次对分离自越南朗姑湾咸水环境的暹罗芽孢杆菌(Bacillus siamensis) B03菌株进行了系统性表征。该菌株表现为无溶血活性、中度生物膜形成能力、耐受10%氯化钠(NaCl)以及广谱胞外酶分泌特性。其无细胞上清液的乙酸乙酯提取物对五种弧菌(Vibrio spp.)展现出体外抗菌活性，抑菌圈直径达14.7–22.3 mm。代谢组学分析初步鉴定出20种化合物，主要为环二肽类(cyclic dipeptides)，部分化合物已被报道具有抗菌特性。

该菌株的质粒游离基因组草图(3,745,205 bp)具有46.4%的GC含量，编码3,561个蛋白质和72个tRNA，基因功能主要集中于氨基酸与碳水化合物代谢。基因组中发现多个次级代谢产物合成基因簇，包括杆孢菌素(bacillaene)、丰原素(fengycin)、地非西丁(difficidin)、杆菌霉素(bacillibactin)(100%相似度)和表面活性素(surfactin)(78%相似度)。通过对24个暹罗芽孢杆菌基因组的泛基因组分析，鉴定出2,254个核心基因，其中B03菌株特有的31个基因包括编码NAD依赖性苹果酸酶(NAD-dependent malic enzyme)和腺苷化结构域蛋白(adenylation domain proteins)的基因。这些发现表明暹罗芽孢杆菌B03具有作为弧菌病原生物防治剂的潜力。