红酵母Cystofilobasidium infirmominiatum HZR20类胡萝卜素与脂质生物合成的多组学机制解析及其工业应用潜力

来自中国南部红树林环境的科研团队通过整合Oxford Nanopore与Illumina NovaSeq技术，首次完成嗜油红酵母Cystofilobasidium infirmominiatum的基因组组装（27.61 Mb，N50=1,144,974 bp），结合LC/GC-MS代谢组学揭示其合成3种类胡萝卜素、839种脂质及1,876种挥发性有机物的能力，为微生物合成生物学提供关键基因资源与代谢网络框架。

　　

通过整合牛津纳米孔（Oxford Nanopore）和Illumina NovaSeq测序技术，研究团队首次完成了嗜油红酵母^{Cystofilobasidium infirmominiatum} HZR20株的基因组组装。该基因组大小为27.61 Mb，包含35个scaffold，N50长度为1,144,974 bp，GC含量为68.21%，并预测编码10,719个蛋白质编码基因，其中8,045个基因通过NR数据库完成功能注释。基于LC/GC-MS的代谢组学分析表明，该酵母可合成至少3种类胡萝卜素（carotenoids）、839种脂质（lipids）、1,876种挥发性有机化合物（VOCs）以及540种其他代谢物。整合多组学分析进一步鉴定了与类胡萝卜素生成（carotenogenic）和脂质合成（lipogenic）相关的关键基因及其代谢中间体。这些发现显著深化了对该酵母合成代谢机制的理解，为分子生物学与比较基因组学研究提供了宝贵资源，同时拓展了对该物种遗传特性与进化动态的认识。