基于ddRAD-seq的急流鲶鱼适应性遗传变异与栖息地丧失关联性研究

【字体: 时间:2025年09月27日 来源:Conservation Genetics Resources 0.9

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  本研究针对急流性鱼类在栖息地丧失背景下遗传变异模式的研究空白,来自巴西的研究团队采用ddRAD-seq技术对受强人为影响的Baryancistrus属鲶鱼进行基因组分析,成功获得551-60,687个地理信息性SNP位点。通过优化生物信息学参数发现,40%缺失数据过滤策略可显著提升数据集对称性与稳定性,该成果为亚马逊濒危特有鱼类的保护遗传学研究提供了关键数据支持。

  
通过双酶切限制性位点关联DNA测序(ddRAD-seq)技术,对采集自强人为干扰环境下的Baryancistrus属急流性鲶鱼样本进行基因组探索,旨在解析其核DNA单核苷酸多态性(SNP)位点的地理分布特征。研究团队系统评估了多种生物信息学参数组合,构建的SNP数据集规模介于551至60,687个位点之间。值得注意的是,采用40%缺失数据过滤阈值时,数据集表现出更低的离散度和更高的对称性。这些高质量SNP数据集的发布,为开展大规模保护遗传学研究提供了重要资源,对揭示亚马逊流域特有濒危鲶鱼的进化适应机制及制定保护策略具有显著价值。
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