iBody介导的合成细胞因子受体激活调控:基于纳米抗体界面工程的理性设计
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时间:2025年09月27日
来源:mAbs 7.3
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本研究通过理性设计纳米抗体框架突变,构建了具有自组装能力的iBody结构,成功实现了合成细胞因子受体的可调控激活。该系统通过降低受体间距离促进gp130ICD二聚化,显著增强JAK-STAT信号传导,为CAR-T细胞治疗和合成生物学提供了新型分子工具。
纳米抗体(Nanobody)作为源自骆驼科动物重链抗体的单域抗体片段,凭借其高结合亲和力、小分子量、优异稳定性及灵活表位识别能力,已成为分子生物学和治疗应用领域的重要工具。本研究聚焦于纳米抗体与合成细胞因子受体的融合构建,通过理性设计纳米抗体框架突变,调控受体激活特性。
研究团队将gp130特异性纳米抗体(GP01、GP11、GP13、GP20)与gp130受体的跨膜区和细胞内域(gp130ICD)融合,构建了合成细胞因子受体。这些受体在HEK293T细胞中能够表达并结合可溶性gp130-Fc(sgp130-Fc),但无法诱导STAT3磷酸化,表明受体间距离可能过大导致激活失败。
受天然广泛中和抗体DH851.3的启发,研究人员在GP11纳米抗体框架中引入了8个关键突变,形成i-shaped纳米抗体二聚体(iBody)。AlphaFold建模显示这些突变通过疏水相互作用促进纳米抗体二聚化。将突变体iGP11与gp130ICD融合后,在Ba/F3细胞中实现了配体依赖的受体激活:sgp130-Fc以0.84±0.39 nM的EC50诱导STAT3磷酸化和细胞增殖。值得注意的是,iGP11-gp130受体表现出配体非依赖性组成型激活,JAK抑制剂P6能够以124.37±18.24 nM的IC50抑制这种自增殖活性。
通过结构模型指导,研究人员进一步开发了减少突变数量的变体:iGP11-Reduced(5个突变)和iGP11-Minimal(4个突变)。PRODIGY预测显示这些变体的二聚化亲和力逐渐降低(Kd值分别为6.13±5.31 μM和34.25±22.17 μM)。实验证实减少突变确实降低了配体非依赖性激活,同时保留了配体依赖的激活能力。时间动力学分析显示,减少突变变体的STAT3磷酸化峰值出现延迟,且表现出更正常的负反馈调节。
在表达内源性gp130的Ba/F3-gp130细胞中,所有纳米抗体融合受体均表现出强烈的自增殖表型,表明受体与内源性gp130形成异源二聚体。共培养实验排除了细胞间相互作用(juxtacrine)的可能性,竞争实验使用可溶性GP11-Fc证实了细胞膜上异源二聚体的形成。
研究团队将iBody突变策略应用于靶向帕利珠单抗(palivizumab)的抗独特型纳米抗体AIP3。在Ba/F3细胞中,iAIP3-gp130受体能够被帕利珠单激活(EC50=2.71-17.21 nM),而野生型AIP3-gp130则无此功能。减少突变变体同样表现出延迟的激活动力学和降低的组成型活性,证明了iBody策略的通用性。
本研究开发的iBody技术平台通过精细调控纳米抗体框架的相互作用能力,实现了合成细胞因子受体的可编程激活。这种策略不仅适用于gp130信号系统,还可推广至其他需要二聚化激活的受体系统,如干扰素γ信号通路和CAR-T细胞设计。特别是基于帕利珠单抗的激活系统,由于该抗体已获批临床使用且安全性良好,为未来体内应用提供了理想平台。
基于抗gp130纳米抗体的构建体主要作为受体工程研究的模型系统,由于gp130在几乎所有细胞类型中普遍表达,这些构建体不太适合翻译应用(如CAR-T细胞治疗)。靶向帕利珠单抗的抗独特型纳米抗体可能更适合体内应用,但需要进一步研究验证。
研究使用Ba/F3、HEK293T和Phoenix-Eco细胞系,通过逆转录病毒转导表达纳米抗体融合受体。蛋白质表达使用ExpiCHOTM系统,通过Protein A亲和色谱纯化。功能实验包括增殖测定、细胞内STAT3/pSTAT3染色、Western blot分析和免疫荧光结合测定。计算建模使用AlphaFold 2和ColabFold进行,结合PRODIGY和DDMut-PPI进行结合能预测和界面分析。
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