综述:鹰嘴豆中尖孢镰刀菌萎蔫专化型感染的生物分子与计算洞察

《Discover Agriculture》:Biomolecular and computational insights into Fusarium oxysporum f. sp. ciceris infection in chickpea: a review

【字体: 时间:2025年09月27日 来源:Discover Agriculture

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  本综述系统阐述了由尖孢镰刀菌萎蔫专化型(Foc)引起的鹰嘴豆萎蔫病的病理机制与防治策略。文章聚焦于病原菌的侵染过程(如CAZymes的作用)、植物的多层次防御反应(包括PTI/ETI免疫系统及次生代谢物如酚酸、黄酮类的调控),并强调了组学(OMICS)与人工智能(AI)/机器学习(ML)技术在抗病育种和病害早期诊断中的应用前景,为制定可持续农业策略以保障粮食安全(SDG2)提供了重要见解。

  
鹰嘴豆(Cicer arietinum L.)是一种重要的豆类作物,但其生产受到由尖孢镰刀菌萎蔫专化型(Fusarium oxysporum f. sp. ciceris, Foc)引起的萎蔫病的严重威胁。这种土传真菌通过根部侵入宿主,定殖于维管组织,堵塞木质部导管,最终导致植株萎蔫死亡。
Foc的流行病学、地理分布与症状学
F. oxysporum 物种复合体(FOSC)包含许多专化型(formae speciales)。在Foc中,已鉴定出8个致病小种(0, 1A, 1B/C, 2-6)。这些小种在地理分布和引起的症状上存在差异,例如,小种0和1B/C主要引起黄化症状,而小种1A, 2, 3, 4, 5和6则引起典型的萎蔫症状。该病害在高温(25-30°C)、干燥的气候和特定土壤pH(5.0-8.0)条件下更为流行,对地中海地区、印度次大陆和加利福尼亚的鹰嘴豆生产造成严重损失。
次生代谢产物及其营养保健品价值
鹰嘴豆富含多种对人体健康有益的次生代谢产物。这些化合物不仅帮助植物抵抗胁迫,还具有重要的营养保健功能。例如,酚类化合物(如儿茶素、槲皮素)、黄酮类(如木犀草素、芹菜素)、异黄酮(如染料木素、大豆苷元)以及酚酸(如没食子酸、阿魏酸)等,具有抗氧化、抗炎、抗癌、改善心血管健康、调节血糖和促进肠道健康等多种生理活性。低血糖指数和抗性淀粉(如棉子糖、水苏糖)的存在使其对糖尿病患者有益。
宿主-病原体相互作用与防御应答机制
Foc的侵染成功取决于温度、pH值、土壤湿度和接种体密度等多种因素。病原菌通过产生角质酶、碳水化合物活性酶(CAZymes)、毒素(如镰刀菌酸)和效应蛋白等武器,破坏植物细胞壁并抑制宿主防御。
植物则通过多层次防御系统进行反击。病原体相关分子模式(PAMPs)被植物的模式识别受体(PRRs)识别,触发PTI。效应蛋白被细胞内NB-LRR受体识别,则激活效应因子触发的免疫(ETI)。这些免疫反应导致活性氧(ROS)爆发、钙离子流、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)级联反应激活,以及水杨酸(SA)、茉莉酸(JA)和乙烯(ET)等防御激素信号通路的上调,进而引发系统获得性抗性(SAR)和过敏反应(HR)。此外,植物还会通过细胞壁木质化和栓质化、形成肼胍质和树胶等物理屏障来限制病原菌扩展。
SGNH水解酶超家族等CAZymes在病原菌突破植物细胞壁过程中扮演关键角色。相反,植物也会产生多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白(PGIPs)等蛋白质来抑制病原菌的酶活性。
遗传变异与分子标记辅助技术
鹰嘴豆对Foc的抗性通常由单基因或寡基因控制。分子标记技术,如随机扩增多态性DNA(RAPD)、简单序列重复(SSR)、序列特征化扩增区域(SCAR)标记等,已被广泛应用于鉴定抗病基因、分析病原菌遗传多样性以及进行标记辅助选择(MAS)。例如,抗Foc小种0的抗性基因被定位在连锁群(LG)5上,而抗小种1A, 2, 3, 4, 5的抗性基因则成簇分布在LG2上。
生物信息学及AI/ML在萎蔫病控制中的作用
组学技术(基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学)为理解宿主-病原体相互作用提供了海量数据。生物信息学分析有助于识别关键的抗病基因和通路。
人工智能(AI)和机器学习(ML)技术在病害早期诊断和预测方面展现出巨大潜力。例如,卷积神经网络(CNN)、长短期记忆网络(LSTM)等深度学习模型已被用于基于图像(可见光、热成像)的萎蔫病严重度自动识别和分类,准确率可达90%以上。这些技术有助于实现精准农业和病害的实时监测。
结论与展望
未来研究应综合运用现代生物技术(如CRISPR-Cas9、RNAi)、组学技术和AI/ML工具,加速培育抗病、气候智能型的鹰嘴豆品种。利用野生近缘种和地方品种的遗传多样性,结合可持续的农业实践(如生物防治、土壤健康管理),对于有效管理萎蔫病、保障鹰嘴豆生产的可持续性和全球粮食安全(SDG2)至关重要。
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