RNA聚合酶II亚基介导的动态U2AF循环调控转录耦联剪接的双相机制

本研究揭示了转录与pre-mRNA剪接协同调控的新机制。研究人员发现Pol II通过RPB9亚基与剪接因子U2AF1直接互作启动3'ss识别，而U2AF2以单体形式参与后续剪接体组装。该发现阐明了动态U2AF循环介导的剪接双相模型，为基因表达调控和疾病机制研究提供新范式。

　　

在真核细胞中，转录与 precursor messenger RNA（pre-mRNA）剪接紧密耦联。本研究突破传统认知，发现RNA聚合酶II（Pol II）的C端结构域（CTD）并非剪接因子招募的关键，而是其亚基RPB9直接与剪接因子U2AF1（U2 small nuclear RNA auxiliary factor 1）相互作用，负责定义功能性3'剪接位点（3'ss）。令人意外的是，U2AF异源二聚体中的大亚基U2AF2并不参与Pol II复合体形成。

研究团队进一步发现单体形式的U2AF2能以浓度依赖性方式将U2AF1从固定的RPB9上释放。这一发现颠覆了U2AF始终以稳定异源二聚体形式存在的传统认知，揭示了动态的"U2AF循环"机制：早期Pol II依赖相由RPB9-U2AF1介导剪接位点识别，后期Pol II非依赖相则由U2AF2接管完成剪接体组装。基因组学分析证实了这一分工——U2AF1主要与Pol II在DNA上共定位，而U2AF2优先结合富含嘧啶的RNA。

该研究提出了转录耦联剪接的双相模型：首先通过Pol II介导的剪接位点识别形成初始外显子定义复合体，随后通过U2AF异源二聚体的动态形成触发该复合体从延伸中的Pol II释放，最终在新生RNA上完成剪接体组装。这种机制确保了不同内含子可采取差异化的剪接动力学，部分剪接反应甚至可能在转录完成后进行。