法意西三国车前草潜隐病毒全基因组测序揭示欧洲分布与遗传进化特征

本研究由来自法国、意大利及西班牙的研究团队开展，针对车前草潜隐病毒（PlLV）在欧洲的分布与遗传特征展开系统研究。通过全基因组测序与系统发育分析，首次证实PlLV广泛存在于西欧地区，其与芬兰分离株基因组相似性达94.17–97.85%，为理解Capulavirus属病毒的演化传播提供了重要分子依据。

　　

研究人员对最初在芬兰发现的车前草潜隐病毒（Plantago lanceolata latent virus, PlLV）开展了西欧地区分布调查。该病毒属于双生病毒科（Geminiviridae）Capulavirus属，可感染长叶车前草（Plantago lanceolata L.）且不引起明显症状。通过对法国（94份）、意大利（17份）和西班牙（20份）采集的131份无症状植株样本进行PCR检测，发现法国2份、意大利1份及西班牙3份样本呈PlLV阳性。

研究团队采用毗邻引物Pla_pstIF/Pla_pstIR对四个阳性样本（分别来自法国布列塔尼和朗格多克、西班牙加利西亚、意大利艾米利亚-罗马涅）进行全基因组扩增，获得2,832-2,834 bp的完整基因组（GC含量41.8%）。通过SDT v1.2软件进行全基因组核苷酸一致性分析，显示西欧分离株与芬兰参考株序列一致性达94.17%-97.85%，高于Capulavirus属的物种划分阈值。

进一步采用MAFFT进行多序列比对，基于完整基因组、复制相关蛋白（REP）和外壳蛋白（CP）的氨基酸序列构建最大似然系统发育树（FastTree, 1,000次自举重复）。三类进化树均显示西欧分离株与芬兰株形成紧密进化簇，自举支持率显著。该研究首次证实PlLV不再局限于波罗的海群岛，而是在西欧地区广泛分布，为理解Capulavirus属病毒的进化动力学提供了关键数据。

基因组序列已存入GenBank，登录号分别为PV656757（法国朗格多克A11-6株）、PV656758（西班牙加利西亚9-1株）、PV656759（意大利艾米利亚-罗马涅I20-3株）及PV656760（法国布列塔尼QuiberonD4株）。