综述:人工智能驱动的口腔微生物组癌症预测最新进展
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时间:2025年09月28日
来源:PERIODONTOLOGY 2000 15.7
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本综述系统探讨了人工智能(AI)在口腔微生物组与口腔癌(尤其是口腔鳞状细胞癌OSCC)关联研究中的前沿应用,涵盖微生物组测序技术、机器学习(ML)算法(如随机森林、支持向量机)在生物标志物挖掘中的作用,以及微生物群通过炎症(如NF-κB、IL-6/STAT3通路)、DNA损伤和代谢调控(如短链脂肪酸SCFAs)影响致癌机制的深度解析,为早期诊断和个性化治疗提供新视角。
3 口腔微生物群与口腔癌
3.1 口腔癌危险因素
口腔鳞状细胞癌(OSCC)作为头颈部鳞癌(HNSCC)的主要亚型,其发生发展与口腔微生物群的生态失衡密切相关。流行病学研究显示,吸烟、饮酒和嚼槟榔等行为因素可导致口腔微生物多样性降低,促进具核梭杆菌(Fusobacterium nucleatum)、牙龈卟啉单胞菌(Porphyromonas gingivalis)等致病菌的富集。这些微生物通过代谢产生乙醛、活性氧(ROS)等致癌物质,诱导宿主DNA双链断裂(如γ-H2AX焦点形成),并抑制p53和Ku70等DNA修复蛋白表达,从而驱动基因组不稳定性。
3.2 口腔微生物群失调与口腔癌进展
高通量测序技术(如16S rRNA测序、宏基因组学)揭示OSCC患者唾液和组织样本中微生物群的显著特征:链球菌(Streptococcus)、普雷沃菌(Prevotella)和嗜血杆菌(Haemophilus)的相对丰度下降,而梭杆菌、肽链球菌(Peptostreptococcus)和卡普诺胞菌(Capnocytophaga)显著上升。这种失调模式与肿瘤分期、淋巴结转移和术后复发风险密切相关。例如,具核梭杆菌通过激活E-钙黏蛋白/β-连环蛋白(E-cadherin/β-catenin)信号通路促进上皮-间质转化(EMT),而牙龈卟啉单胞菌产生的丁酸盐可抑制淋巴细胞功能,削弱免疫监视。
3.3 口腔微生物群、炎症与DNA损伤应答
微生物群失调通过Toll样受体(TLR)/髓样分化因子88(MyD88)途径激活核因子κB(NF-κB)和MAPK信号通路,促使IL-6、TNF-α等促炎细胞因子释放,形成慢性炎症微环境。此外,中间普雷沃菌(Prevotella intermedia)产生的硫化氢(H2S)抑制超氧化物歧化酶(SOD)活性,导致活性氧累积并引发氧化性DNA损伤。NLRP3炎症小体的异常激活进一步加剧IL-1β介导的致癌进程,而微生物代谢产物短链脂肪酸(SCFAs)的减少会破坏游离脂肪酸受体2(FFAR2)介导的抗炎信号,形成促癌正反馈循环。
3.4 口腔微生物群作为诊断与预后工具
机器学习模型(如随机森林、支持向量机)通过分析微生物组数据,实现了OSCC的早期预测和风险分层。研究表明,唾液样本中链球菌和细小单胞菌(Parvimonas)的富集与患者总生存期(OS)及无病生存期(DFS)缩短显著相关,而韦荣球菌(Veillonella)和 Corynebacterium 则表现出保护性作用。通过主成分分析(PCA)和聚类算法构建的微生物特征模型,在跨中心验证中展现出超过85%的预测准确率(AUC值),为无创诊断提供了新策略。
4 口腔微生物组样本采集与标准化
样本类型的选择(如非刺激性唾液、口腔拭子、组织活检)显著影响微生物组数据的可靠性。唾液样本虽易于获取,但可能低估黏膜深层微生物的丰度;组织活检能精准反映肿瘤局部菌群,但存在侵入性操作偏差。标准化流程涉及样本采集时间、DNA提取方法和测序区域(如16S rRNA V3–V4区)的统一,以减少技术噪音。未来需通过多中心纵向研究验证微生物标志物的临床适用性,并整合多组学数据(代谢组、蛋白质组)以提升预测模型的鲁棒性。
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