破译骨关节炎中成纤维细胞异质性:发现纤维化相关亚型及新型诊断标志物
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时间:2025年09月28日
来源:MEDIATORS OF INFLAMMATION 4.2
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本研究针对骨关节炎(OA)中成纤维细胞异质性机制不明的问题,通过整合单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据和生物信息学分析,揭示了与纤维化相关的成纤维细胞亚型及其动态演变轨迹,并筛选出具有诊断潜力的生物标志物,为OA的精准诊疗提供了新思路。
成纤维细胞作为细胞外基质重塑和纤维化的关键参与者,在骨关节炎(osteoarthritis, OA)的发病机制中起着重要作用。然而,其在OA中的异质性及功能亚型尚未明确。研究人员从基因表达综合(Gene Expression Omnibus, GEO)数据库获取了OA的单细胞RNA测序(single-cell RNA sequencing, scRNA-seq)数据及两个独立数据集,运用Seurat软件包进行数据标准化、降维和细胞类型鉴定。通过基因集富集分析(gene set enrichment analysis, GSEA)识别各细胞簇中显著富集的生物学过程(biological processes, BPs)。借助Monocle2软件包,基于成纤维细胞亚型中动态基因表达变化分析OA进展轨迹。最后,结合单样本GSEA(single sample GSEA, ssGSEA)与差异表达分析筛选OA诊断生物标志物,并评估其诊断价值。
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