优化DNA条形码与定制参考数据库提升新热带哺乳动物宏条形码鉴定效能

本研究针对新热带地区哺乳动物多样性评估中遗传标记选择难题，由巴西研究团队开发覆盖72%本土物种（含濒危物种）的定制参考数据库，通过in-silico和in-vitro测试优化COI/RNA12S/RNA16S多标记体系，显著提升分类鉴定准确性，为生物多样性保护提供可靠技术方案。

　　

新热带生物群落以其极高的生物多样性和严峻的生存威胁而备受关注。为应对这些受威胁且研究不足的生态系统（如巴西各生物群落）对生物多样性评估的迫切需求，研究人员采用宏条形码（metabarcoding）等现代技术来生成详细的物种分类清单。然而，遗传标记的选择始终存在挑战——不同标记与引物对可能因核苷酸序列差异和参考数据库的局限性，优先扩增特定分类群从而引入偏差。

该研究通过开发专用于巴西哺乳动物的定制化参考数据库和优化引物体系，推动了生物多样性研究的发展。该数据库覆盖72%的本地物种（包括濒危物种），显著提升了所有巴西生物群落的物种鉴定准确性。研究团队通过计算机模拟（in-silico）和体外实验（in-vitro）系统评估并优化了最适合的遗传标记与引物组合，比较了它们的分类覆盖度和分辨率。

研究显示，通过对细胞色素c氧化酶亚基I（COI）引物进行定制化修饰，降低了与巴西哺乳动物序列的错配率，大幅提高分类覆盖范围，其表现优于文献中常用引物。更重要的是，结合COI与核糖体12SRNA（RNA12S）、16SRNA（RNA16S）标记可提供重要且互补的信息，增强分类鉴定的可靠性，有效应对新热带地区哺乳动物多样性带来的技术挑战。这种多标记联用策略为提升新热带地区宏条形码鉴定效能提供了可靠方案，有助于支持更有效的生物保护行动。