核基因SNP标记证实Lethenteron satoi(七鳃鳗科)的遗传独特性
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时间:2025年09月28日
来源:Ichthyological Research 1
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来自日本的研究人员通过MIG-seq技术获得SNP标记,解析了Lethenteron satoi的系统发育地位,确认其作为独立物种的遗传独特性,并聚类于Lethenteron camtschaticum等近缘种,为环境DNA宏条形码(eDNA metabarcoding)提供了可靠的线粒体12S rRNA序列依据。
近期在日本北海道石狩川水系发现的Lethenteron satoi(七鳃鳗科)物种,虽已通过线粒体DNA(mitochondrial DNA, mtDNA)序列和形态特征组合被初步区分,但其物种地位仍需核DNA证据进一步验证。研究人员采用多重ISSR测序分型(multiplexed ISSR genotyping-by-sequencing, MIG-seq)方法获得单核苷酸多态性(SNP)标记,分析了该物种与日本五种Lethenteron属 lampreys的系统发育独立性和聚类关系。混合分析和网络分析均表明,L. satoi是一个遗传上独立的物种,且与Lethenteron camtschaticum、Lethenteron reissneri和Lethenteron mitsukurii的亲缘关系更近,而与Lethenteron hattai较远——这一结果与mtDNA系统发育结论一致。研究还提供了五种日本Lethenteron物种的线粒体12S核糖体RNA(12S rRNA)序列,用于环境DNA宏条形码(environmental DNA metabarcoding)分析,证实这些序列可有效区分L. satoi与其他物种。
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