综述:植物核糖体病:对植物核糖体蛋白基因突变体的新见解与批判性重估

【字体: 时间:2025年09月28日 来源:Current Opinion in Physiology 1.9

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  本综述系统探讨了植物核糖体稳态(Ribosome Homeostasis)失衡引发的发育缺陷现象,提出借鉴人类核糖体病(Ribosomopathies)框架解析植物突变体表型。作者强调核糖体可用性(Ribosome Availability)限制对叶片形态建成(如齿状叶缘、脉序紊乱)的特异性影响,主张通过翻译组学(Translatomics)技术(如Ribo-Seq)解析核糖体敏感过程的分子机制,为降低作物施肥需求提供新策略。

  
翻译的成本:核糖体与细胞代谢
核糖体作为翻译遗传信息为功能蛋白的通用保守巨型复合物,其可用性通常是生长与发育的限速因子。植物拥有三种截然不同的核糖体类型:分别存在于细胞质、质体以及线粒体中。这些机器需要巨大的营养投入,在叶片中可占据高达50%的有机磷和25%的有机氮。因此,优化核糖体水平有望降低作物对肥料的需求,这对农业可持续性而言是一个紧迫的目标。
核糖体病:异质性还是稳态?
“核糖体病”这一概念源于人类疾病,指由多种核糖体蛋白(RP)基因或核糖体生物发生因子突变引起的 disorders。其中最典型的是Diamond-Blackfan贫血,其特征是红细胞水平显著降低,且超过50%的病例是由eS10eS17eS19eS24eS26uL5uL18eL33等基因的单倍剂量不足(Haploinsufficiency)所引起。这类疾病表明,核糖体缺陷并非简单导致全面生长阻滞,而是引发具有高度组织特异性的发育综合征,这提示核糖体稳态(Ribosome Homeostasis)的破坏会特异性地影响某些mRNA的翻译,而非全局性的蛋白质合成下降。
植物核糖体病:植物发育生物学的新兴范式
在植物中,最常见的核糖体病表现为叶片形态模式的缺陷。拟南芥RP基因突变体往往产生窄而尖端、边缘呈齿状、叶脉模式紊乱且近似平行的叶片(图1)。与人类疾病类似,该表型可由多种RP基因突变引起,包括但不限于eS6uS7eS10uS13eS21eS24eS28uL1uL4eL18uL18uL23等。这些发现强烈暗示,某些发育过程(如叶片 patterning)对核糖体水平的变化具有特殊敏感性。
绕道至细胞器:植物细胞器核糖体病
植物的核糖体病并不局限于细胞质RP基因。与细胞质核糖体不同,大多数植物细胞器(如质体和线粒体)RP由单拷贝基因编码,尽管部分存在两个或更多旁系同源物(拟南芥中约13%属于此类)。此外,细胞器核糖体由核基因和细胞器基因共同编码。正向和反向遗传学筛选已发现许多细胞器RP突变体,它们也表现出特定的发育缺陷,进一步扩展了植物核糖体病的范畴。
植物核糖体病与植物翻译的未来
为阐明为何植物核糖体病 consistently 引起相似的发育综合征,必须进行高质量的全基因组翻译(即“翻译组学”,Translatomics)测量。目前主要有两种方法:主动翻译mRNA的高通量测序(多聚核糖体mRNA测序和核糖体足迹谱法,Ribo-Seq)以及新生蛋白质的代谢标记。其中Ribo-Seq(以及在较小程度上的多聚核糖体mRNA测序)正日益成为研究植物基因表达调控的首选工具。这些技术有望揭示哪些mRNA转录本和生物学过程对核糖体可用性的变化最为敏感,从而为通过工程手段绕过限制核糖体可利用性的有害效应、优化作物性状提供 mechanistic 见解。
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