利用多重RT-PCR实现小鼠单克隆抗体的同步同种型鉴定与互补决定区分析

【字体: 时间:2025年09月29日 来源:Methods 4.3

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  本文开发了一种集成化分子表征策略,通过设计含通用适配序列的多重反转录引物(Multiplex-RT),无需预先获知抗体同种型即可合成cDNA,并结合同种型特异性PCR(Iso-PCR)同步鉴定小鼠单抗的同种型、IgG亚类与互补决定区(CDR)序列,为抗体工程与重组生产提供高效技术路径。

Highlight
高效同种型非依赖型cDNA合成由多重RT引物实现
为建立可靠的小鼠免疫球蛋白可变区扩增方法,我们首先从IMGT数据库收集重链与轻链同种型序列,通过多序列比对寻找适用于通用引物的保守区域。然而不同同种型间序列分化程度过高,无法跨所有类别找到单一保守区(图S1),因此无法设计出覆盖全部同种型的单一通用引物。
讨论
既往基于PCR的抗体可变区测序策略在设计通用引物方面面临困难。采用针对5′端区域的简并引物替代方案成功率仅80–90%,主要归因于非特异性引物结合或扩增失败[[23], [24], [25], [26]]。依赖5′ RACE(快速扩增cDNA末端)的方法需经历mRNA加尾、cDNA纯化等多步骤,操作繁琐且成功率有限。
细胞培养与转染
自制杂交瘤细胞系通过脾细胞与SP2/0骨髓瘤细胞系(ATCC #CRL-1581)融合制备[[37]]。脾细胞取自经合成肽或重组蛋白免疫的小鼠:小鼠MLC1(克隆37E5)与小鼠SHLP2(克隆5E3)的合成肽;人TREM2(克隆T3A11C2)与人Lcn2(克隆3F1)的重组蛋白。IVA12杂交瘤(HB-145)购自ATCC。杂交瘤细胞用Hybridoma-SFM培养基培养。
生成式AI与AI辅助技术使用声明
论文撰写过程中,作者使用ChatGPT5进行语法检查。使用该工具后,作者对内容进行了必要的审阅与编辑,并对已发表文章的内容承担全部责任。
CRediT作者贡献声明
Junmo Hwang: 撰写初稿,概念化,研究实施,数据整理,验证,形式分析。Eunbi Kim: 审阅编辑,研究实施,数据整理,验证。Jina Kim: 审阅编辑,研究实施,数据整理,验证。Sujin Shin: 审阅编辑,研究实施,数据整理,验证。Hyun-Ho Lim: 撰写初稿,审阅编辑,概念化,资源提供,监督指导,项目管理。
利益冲突声明
作者声明以下可能构成潜在利益冲突的财务/个人关系:Hyun-Ho Lim拥有已授权专利#KR-10–2156165(权属:DGIST、ASAN基金会与蔚山大学),及申请中专利#KR-10–2023-0029962(权属:DGIST)。Junmo Hwang拥有申请中专利#KR-10–2023-0029962(权属:DGIST)。Hyun-Ho Lim与Junmo Hwang共同拥有申请中专利#KR-10–2025-0070978(权属:DGIST)。鉴于其编辑角色,作者承诺透明处理。
致谢
本研究受韩国脑研究院(KBRI)基础研究计划(编号25-BR-01-02与25-BR-05-07至H.H.Lim)与ELA国际(编号ELA no.2024-01814至H.H.Lim)资助。感谢Lim实验室全体成员在研究过程中提供的及时帮助。

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