IRG1催化代谢物衣康酸通过烷基化TBK1抑制I型干扰素依赖性免疫反应

【字体: 时间:2025年09月29日 来源:Cell Reports 6.9

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  本研究发现能量代谢与天然免疫调控的新机制:病毒感染后期诱导IRG1表达,催化产生衣康酸,通过烷基化TBK1第605位半胱氨酸(Cys605)破坏其二聚化,从而抑制I型干扰素(IFN-I)过度产生。研究团队进一步开发出衣康酸衍生物ITA-5和ITA-9,能有效抑制TBK1活性,在多种小鼠模型中缓解IFN-I介导的过度炎症反应,为自身免疫疾病和I型干扰素opathy提供了潜在治疗策略。

  
在抗病毒免疫应答中,I型干扰素(IFN-I)的产生是宿主防御的关键机制,但其过度产生会导致严重的免疫病理损伤。TANK结合激酶1(TBK1)作为天然免疫信号通路的核心激酶,其活性调控对维持免疫平衡至关重要。近年来,免疫代谢研究揭示能量代谢产物可作为信号分子调控免疫反应,但代谢产物如何精确调控TBK1活性仍不清楚。
本研究团队发现病毒感染后期,免疫应答基因1(IRG1)表达上调,催化三羧酸循环中间体顺乌头酸产生衣康酸(itaconic acid)。这种能量代谢产物通过烷基化TBK1第605位半胱氨酸(Cys605),破坏TBK1的二聚化和活化,从而抑制IFN-I的过度产生。研究人员进一步开发出两种衣康酸衍生物ITA-5和ITA-9,证实它们能特异性靶向TBK1,有效缓解多种小鼠模型中的过度炎症反应。
研究采用的主要技术方法包括:靶向能量代谢组学(LC-MS/MS)分析病毒感染后的代谢物变化;CRISPR/Cas9基因敲除技术构建Irg1-/-和Trex1-/-小鼠模型;表面等离子共振(SPR)和细胞热位移分析(CETSA)检测小分子与TBK1的结合;分子对接和动力学模拟解析烷基化作用机制;以及多种小鼠疾病模型(poly(I:C)诱导的过度炎症模型、TMPD诱导的狼疮模型和Trex1缺失引起的I型干扰素opathy模型)进行体内功能验证。
研究结果
IRG1-衣康酸轴反馈抑制TBK1触发的I型干扰素应答
研究发现VSV和HSV-1感染后,小鼠原代腹腔巨噬细胞(PMs)中IRG1表达显著上调,细胞内衣康酸水平随时间推移而增加。Irg1缺失导致病毒感染8小时后Ifnb mRNA表达和IFN-β分泌显著增强,TBK1和IRF3磷酸化水平升高,表明IRG1在病毒感染后期作为反馈调节因子抑制过度免疫反应。
衣康酸和4-辛基衣康酸抑制病毒感染诱导的IFN-β产生
通过代谢组学筛选发现衣康酸是唯一能显著抑制VSV和HSV-1感染诱导IFN-β分泌的能量代谢物。衣康酸及其衍生物4-OI处理抑制了多种刺激(VSV、HSV-1、poly(I:C)和ISD)触发的TBK1、IRF3和STAT1磷酸化,且这种抑制不依赖于IFNAR1信号通路。
衣康酸和4-OI通过抑制TBK1二聚化限制其活化
机制研究表明,衣康酸处理抑制TBK1诱导的IFN-β启动子活化,但不影响IRF3-5D(组成型活性突变体)的活化。CETSA显示衣康酸引起TBK1蛋白热位移变化。衣康酸和4-OI处理抑制了TBK1的二聚化和寡聚化,减少TBK1颗粒形成。
衣康酸和4-OI直接烷基化TBK1破坏其二聚化
体外激酶实验显示衣康酸和4-OI剂量依赖性地抑制TBK1激酶活性。SPR分析表明衣康酸和4-OI直接与TBK1结合。使用衣康酸炔烃(ITalk)探针检测发现TBK1(而非IRF3)被明显烷基化。LC-MS鉴定出TBK1的四个保守烷基化位点(Cys267、Cys423、Cys426和Cys605),其中Cys605突变(C605S)显著抑制TBK1烷基化和二聚化。分子对接和动力学模拟显示衣康酸烷基化TBK1 Cys605后影响其二聚界面结构。
ITA-5和ITA-9作为共价TBK1拮抗剂的开发
通过衣康酸结构修饰,研究人员开发出ITA-5和ITA-9两种衍生物,它们比衣康酸和4-OI具有更强的TBK1抑制活性和更低细胞毒性。这两种化合物能有效烷基化TBK1,抑制其磷酸化和寡聚化,在细胞水平和小鼠模型中显著减轻IFN-I介导的炎症反应。
ITA-5和ITA-9限制过度IFN-I介导的过度炎症
在poly(I:C)诱导的急性过度炎症小鼠模型中,ITA-5或ITA-9处理降低血清IFN-β水平和组织Ifnb mRNA表达,减轻多器官损伤。在TMPD诱导的实验性狼疮模型和Trex1缺失引起的I型干扰素opathy模型中,ITA-5和ITA-9处理显著减轻炎症细胞浸润和IFN特征基因表达。
结论与意义
本研究揭示了能量代谢与天然免疫调控的新机制:病毒感染后期诱导的IRG1通过催化产生衣康酸,反馈抑制TBK1活性,防止IFN-I的过度产生。衣康酸通过烷基化TBK1关键位点Cys605,破坏其二聚化和活化,从而精确调控天然免疫应答。
研究的创新性在于:首先揭示了衣康酸作为内源性TBK1抑制剂的分子机制;其次开发出高效特异的TBK1抑制剂ITA-5和ITA-9;最后在多种疾病模型中验证了靶向TBK1的治疗潜力。
该研究不仅为理解免疫代谢调控提供了新视角,也为治疗IFN-I介导的自身免疫疾病(如系统性红斑狼疮、I型干扰素opathy等)提供了新的潜在治疗策略。基于天然代谢物的药物开发策略,为靶向TBK1的疗法开辟了新途径,具有重要的临床转化价值。
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