转录组学与多导睡眠图揭示阻塞性睡眠呼吸暂停的核心信号通路:聚焦NF-κB通路的调控机制与免疫失衡

【字体: 时间:2025年09月30日 来源:MEDIATORS OF INFLAMMATION 4.2

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  本综述通过整合转录组学与多导睡眠图(PSG)数据,深入探讨了阻塞性睡眠呼吸暂停(OSA)的核心分子机制。研究识别出与呼吸暂停低通气指数(AHI)、氧减指数(ODI)等关键临床指标显著相关的基因模块,并发现NF-κB信号通路在OSA的免疫炎症调控中起中心作用。关键基因CEBPB、SPI1等通过调控T细胞亚群分布和NF-κB活化参与疾病进程,为OSA的精准诊断和靶向治疗提供了新视角。

  

1. 引言

阻塞性睡眠呼吸暂停(OSA)是一种常见的睡眠障碍性疾病,全球患病率近10亿人。其特征是睡眠期间上气道反复塌陷导致的部分或完全阻塞,引起慢性间歇性缺氧(CIH)和睡眠结构紊乱。多导睡眠图(PSG)是诊断OSA的金标准,可监测呼吸事件、脑电、肌电、心电等多维参数,并衍生出呼吸暂停低通气指数(AHI)、最低血氧饱和度(LSO2)、氧减指数(ODI)等关键指标。近年来,生物信息学技术的快速发展为解析OSA的分子机制提供了新工具。本研究通过整合PSG与转录组数据,旨在揭示OSA的核心信号通路和关键基因,为疾病机制研究和靶向治疗提供依据。

2. 材料与方法

2.1. 研究人群

研究纳入2022年5月至8月武汉大学人民医院呼吸科收治的打鼾患者。所有参与者接受PSG监测,根据AHI值分为OSA组(AHI>5事件/小时)和单纯打鼾组(非OSA组)。

2.2. 纳入与排除标准

纳入标准包括年龄18-70岁、BMI 18-40 kg/m2、有打鼾症状。排除严重呼吸系统疾病、心血管疾病、精神障碍、长期使用睡眠药物、近期呼吸道感染或严重肥胖(BMI>40 kg/m2)者。

2.3. PSG监测与样本采集

PSG记录包括AHI、最长呼吸事件时长(LAD)、平均血氧饱和度(MSO2)、LSO2、ODI等参数。采集外周血样本,通过Ficoll密度梯度离心分离白细胞,TRIzol法提取总RNA。

2.4. 转录组数据分析

采用Trimmomatic过滤原始测序数据,STAR比对基因组,featureCounts量化表达水平,EdgeR进行差异表达分析。加权基因共表达网络分析(WGCNA)识别与临床参数相关的基因模块,GO和KEGG富集分析探索功能通路。蛋白质互作(PPI)网络通过STRING数据库构建,核心基因通过Cytoscape的CytoHubba插件筛选。

2.5. 单细胞测序与免疫浸润分析

利用GEO数据集GSE214865进行单细胞RNA测序(scRNA-seq)分析,Seurat软件进行质量控制、标准化和聚类。CIBERSORT算法评估免疫细胞浸润,AUCell算法计算通路活性。

2.6. 孟德尔随机化分析

采用两样本孟德尔随机化(MR)分析CEBPB基因与NF-κB通路的因果关系,使用逆方差加权(IVW)和MR-Egger回归方法。

3. 结果

3.1. 临床特征比较

最终纳入18例样本(OSA组9例,打鼾组9例)。两组在性别、年龄、BMI上无显著差异,但OSA组的AHI、LAD、MSO2、LSO2、ODI等参数均显著异常(p<0.05),反映OSA患者存在更严重的呼吸事件和低氧状态。

3.2. 转录组差异分析

主成分分析(PCA)显示OSA与打鼾组在基因表达上存在明显分离。WGCNA识别出302个差异表达基因(DEGs),其中Palevioletred模块与AHI、LSO2、MSO2等参数显著相关(相关系数0.60-0.62,p<0.05)。该模块与DEGs交集获得35个核心基因。

3.3. 功能富集与通路分析

GO分析显示核心基因富集于炎症反应、细菌应答、膜筏结构、组蛋白去乙酰酶结合等功能。KEGG分析提示NF-κB信号通路、人巨细胞病毒感染、凋亡通路显著富集。GSEA进一步验证NF-κB通路活化(NES=1.730,p=0.014)。

3.4. 核心基因与PPI网络

PPI网络分析识别出CEBPB、SPI1、TNFRSF1A、HCK、RARA、CXCR2、LTBR等关键基因,其中CEBPB处于网络中心位置,提示其可能在OSA发病中起核心调控作用。

3.5. 免疫细胞浸润与单细胞分析

免疫浸润分析显示OSA组CD4+ T细胞比例显著降低(p<0.05)。scRNA-seq进一步揭示OSA患者T细胞中NF-κB通路活性升高,且CD4+ T细胞(尤其Tregs)比例减少,CEBPB在CD4+ T细胞中表达上调。

3.6. 孟德尔随机化验证

MR分析证实CEBPB表达与NF-κB通路活性存在因果关系(IVW OR=1.060,95% CI:1.007–1.117,p=0.027),且无显著多效性或异质性。

4. 讨论

本研究通过多组学整合分析,揭示了OSA的分子特征与免疫炎症机制。关键基因CEBPB在缺氧应激下上调,通过激活NF-κB通路促进炎症反应,并导致CD4+ T细胞比例失衡(尤其Tregs减少)。NF-κB通路作为核心枢纽,连接了缺氧、免疫失调和炎症损伤,为OSA的靶向干预提供了新方向。此外,病毒应答通路的富集提示OSA可能存在类似抗病毒免疫的慢性炎症状态。研究局限性包括样本量较小、缺乏功能实验验证等,未来需进一步探索CEBPB-NF-κB轴的具体调控机制。

5. 结论

NF-κB信号通路是OSA发病的核心环节,CEBPB等关键基因通过调控该通路影响免疫细胞功能和炎症反应。靶向NF-κB通路可能成为OSA治疗的新策略。

利益冲突与作者贡献

作者声明无利益冲突。刘培军和杨小兰为共同第一作者。

资助

本研究获湖北省自然科学基金(2025AFB807)资助。
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