中国标题 中国葛根细菌性叶斑病病原体——Robbsia andropogonis FG-1菌株完整基因组破译

来自中国的研究人员针对葛根(Pmt)细菌性叶斑病开展病原基因组研究，通过混合测序技术完成Robbsia andropogonis FG-1菌株高质量基因组组装（6.01 Mb，GC含量59.00%），为揭示病原体毒力机制和制定防控策略提供关键数据支撑。

　　

本研究完整解析了引起中国葛根（Pueraria montana var. thomsonii, Pmt）细菌性叶斑病的病原体——Robbsia andropogonis（罗氏杆菌）FG-1菌株的基因组图谱。研究人员于2024年8月从广东高明地区发病葛根叶片病灶交界处分离获得该菌株，通过经典柯赫氏法则验证其致病性：接种10⁸ CFU/mL菌液后，葛根叶片在7天内呈现典型脉间水浸状病斑伴黄色晕圈（图1）。

采用牛津纳米孔（Nanopore）长读长与Illumina短读长混合测序策略，获得688Mb纳米孔数据（N50=3,224bp）和2Gb Illuminaclean reads（333×覆盖度）。通过Unicycler杂交组装与Pilon两轮校正，最终获得6,011,680bp的高质量基因组，包含3条环状染色体（3.61Mb/1.11Mb/0.56Mb）和5个环状质粒（178kb至129kb）。基因组GC含量59.00%，经CheckM评估完整性达92.02%，BUSCO评估为97.00%。

NCBIPGAP注释显示该基因组包含5,652个基因，包括5,033个蛋白编码基因、548个假基因、55个tRNA基因、12个rRNA基因和4个ncRNA基因。与模式菌株BLB1的平均核苷酸一致性（ANI）达99.32%。该基因组为解析罗氏杆菌的致病机制（包括III型分泌系统、毒素合成等毒力因子）和开发靶向防控技术提供了分子基础。

研究获得国家自然科学青年基金（32202277）支持，通过多单位协作完成基因组解析工作。