玉米根际固氮新菌种Rossellomorea marisflavi A1的全基因组解析及其农业应用潜力
【字体:
大
中
小
】
时间:2025年09月30日
来源:Microbiology Resource Announcements 0.6
编辑推荐:
来自中国的研究人员针对可持续农业发展中生物固氮资源挖掘的需求,完成了从玉米品种先玉335根际分离的固氮菌Rossellomorea marisflavi strain A1的全基因组测序。研究通过PacBio+Illumina混合组装获得4.42 Mb染色体和500 kb质粒的完整基因组,鉴定出5,109个编码基因及固氮相关遗传模块,为微生物肥料开发提供重要种质资源与理论基础。
研究人员报道了从玉米(Zea mays L. cultivar Xianyu 335)根际分离的固氮菌Rossellomorea marisflavi strain A1的完整基因组序列。该菌株在温室条件下从种植8周玉米的自然土壤根际样本中分离纯化,通过16S rRNA基因测序(引物27F/1492R)和平均核苷酸一致性(ANI)分析被鉴定为R. marisflavi(与GCA_001274775.1相似度98.39%)。
基因组采用PacBio RS II单分子实时(SMRT)和Illumina平台进行混合测序,使用Unicycler(v0.4.8)组装和Pilon(v1.22)抛光,最终获得大小为4,417,820 bp的环形染色体和500,082 bp的质粒(GC含量39.40%)。基因预测显示包含5,109个编码序列(CDS)、149个tRNA、33个rRNA和99个sRNA。功能注释基于NCBI非冗余蛋白数据库、Swiss-Prot、Pfam、COG(Clusters of Orthologous Genes)、GO(Gene Ontology)和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)数据库完成。
系统发育分析(Neighbor-Joining法,MEGA v6.0)表明该菌株与Rossellomorea aquimaris及相近物种聚为一支。基因组特征支持其代谢多样性及固氮潜能,为植物-微生物互作机制研究和农业微生物制剂开发提供了遗传基础。
本研究受国家重点研发计划(2023YFD1900504、2022YFD1901304)、国家自然科学基金(32100095)及高校科研基金(2022RC033、2023RC016、2024RC025)支持。
生物通微信公众号
生物通新浪微博
今日动态 |
人才市场 |
新技术专栏 |
中国科学人 |
云展台 |
BioHot |
云讲堂直播 |
会展中心 |
特价专栏 |
技术快讯 |
免费试用
版权所有 生物通
Copyright© eBiotrade.com, All Rights Reserved
联系信箱:
粤ICP备09063491号