长片段核酸如何提高回收效率？

实验室里，隔壁课题组的师兄又兴高采烈地跑出去测序了。他的Nanopore库又构建成功了。

而你，对着琼脂糖凝胶上那若有若无的长片段条带，和第N次失败的克隆转化结果，陷入沉思…

用的都是PCR仪，跑的都是琼脂糖凝胶，切的都是同一个条带，为什么他的长片段得率和完整性总是比我好？是玄学，还是我的手艺问题？

也许，问题并不出在你的操作手艺上，而是你选择的‘工具’本身，就在默默地‘切割’你珍贵的DNA。

这个隐形杀手就是——液压剪切力 (Shear Force)。

传统离心柱法是一项高效、便捷的技术，主要依赖于离液盐介导的核酸在硅胶膜上的可逆吸附。然而，其固有的“过膜”操作方式产生的剪切力，是其处理长片段DNA时的主要短板。

想象一下，当你用极细的吸头反复吹打、或者让DNA溶液高速挤压通过离心柱的致密滤膜时，长长的DNA分子就像一根意大利面，被巨大的水流冲断。传统离心柱法正是这个原理。

而隔壁师兄的秘密武器，就是选择了能避开这个杀手的工具——基于悬浮硅珠技术的回收方案，例如MACHEREY-NAGEL的NucleoTrap®。

这种技术的不同之处在于：整个过程DNA都在溶液中进行，通过与悬浮的硅珠温和地结合、洗涤，最后再被洗脱。就像用手轻轻托起一条大鱼，而不是用网兜猛拉上来，最大限度地避免了机械损伤。

所以，不是他的运气好，而是他的DNA从始至终都被保护得更完整，最终反映在更高的得率、更完整的条带、以及更高的下游实验（克隆、测序）成功率上。

这不仅仅是理论上的优越。实测数据表明，NucleoTrap®对于长达19.4 kb的DNA片段，仍能保持高达74%的回收率。而对于更长的片段（最高至50 kb），只需在洗脱时稍加优化（如在55°C孵育），就能获得极致效果。

两款产品该如何选择呢？

如果你需要从凝胶里切下一个DNA条带（无论大小）进行回收，请选择 NucleoTrap®；

如果你的PCR反应完成后，想直接纯化反应液中的目的产物（并去除引物二聚体等小杂质），请选择 NucleoTrap®CR。

重要提示： 两者都采用温和的硅珠悬浮技术，因此都能高效回收长片段DNA（高达50 kb）。

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