《Ecology and Evolution》：Evolution of Plasticity in Response to Ethanol Between Recently Separated Populations of D. melanogaster With Different Ecological Histories
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本研究通过比较法国（衍生种群）与赞比亚（祖先种群）黑腹果蝇（D. melanogaster）对乙醇的行为耐受性及转录组响应，揭示了表型可塑性通过基因容纳（genetic accommodation）进化的实证证据。赞比亚种群个体间存在显著的基因型特异性转录差异（G×E交互作用），而法国种群响应高度一致，表明自然选择已修剪非适应性可塑性变异。该研究为表型可塑性的进化机制提供了重要跨种群验证。
引言
表型可塑性的适应性进化理论认为其通过基因容纳过程实现。该模型预测：当种群遭遇新环境时，不同基因型会呈现多样化响应，经自然选择修剪后形成单一适应性反应。尽管理论成熟，但实证支持仍显不足。黑腹果蝇对乙醇的适应性为研究该机制提供了理想模型—— cosmopolitan种群（如法国种群）已进化出乙醇耐受性，而祖先种群（如赞比亚种群）仍保持低耐受性这一祖先状态。
方法
研究采用来自法国（FR109、FR112N、FR113N）和赞比亚（ZI274N、ZI31N、ZI418N）的3个近交系基因型。通过行为实验评估雄性果蝇在15%乙醇基质中的活动能力（以跨中线次数为指标），并利用RNA-seq分析头部组织的基因表达和可变剪接响应。实验设计严格控制环境变量，确保生物学重复独立性。
结果
行为学验证
法国果蝇在乙醇暴露后保持活跃状态，而赞比亚果蝇迅速进入镇静阶段，证实两者存在显著耐受性差异（p<0.0001）。
基因表达差异
赞比亚种群表现出更丰富的基因型特异性响应：乙醇处理×基因型交互作用显著基因数达1164个，是法国种群（145个）的8倍。值得注意的是，赞比亚种群中1063个基因显著上调，而法国种群仅9个基因上调，提示适应性进化可能伴随响应抑制。
核心响应基因
两个种群共享136个乙醇响应基因，包括Drat、Pinocchio、cabut、sugarbabe和FASN2等既往研究中反复出现的基因，表明这些基因构成乙醇响应的核心分子基础。
可变剪接分析
赞比亚种群在剪接响应规模上远超法国种群（跳过外显子事件：88 vs. 54）。法国种群剪接响应集中于肌肉/神经发育相关基因（如spalt major、mef2靶基因），而赞比亚种群涉及slowpoke、CASK等神经功能基因。值得注意的是，仅9个基因在表达与剪接分析中重叠，表明两种调控机制相对独立。
讨论
本研究通过更精确的祖先代理谱系（赞比亚黑腹果蝇）验证了基因容纳进化模型：未适应乙醇的种群暴露大量隐性遗传变异（表现为基因型特异性响应），而适应种群经选择形成一致响应。基因表达与剪接响应的分离进化提示可塑性调控的多维性。研究首次在种群内水平证实乙醇耐受性相关可塑性进化遵循基因容纳理论，为表型可塑性的进化动力学提供了关键实证支持。
