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使用SoniCoat技术可实现蛋白质在原位(in situ)的快速高效消化,从而为MALDI质谱成像提供有力支持
《ANALYTICAL AND BIOANALYTICAL CHEMISTRY》:Rapid and efficient in situ digestion of proteins by SoniCoat for MALDI mass spectrometry imaging
【字体: 大 中 小 】 时间:2026年01月07日 来源:ANALYTICAL AND BIOANALYTICAL CHEMISTRY 3.8
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快速原位胰蛋白酶消化方法利用SoniCoat超声基质喷雾器缩短处理时间并避免分子扩散,提高MALDI MSI成像质量,成功揭示肝癌模型中病变与正常区域蛋白分布差异,为癌症生物标志物发现提供新策略。
可视化生物组织切片中蛋白质的空间分布对于蛋白质组学分析至关重要,因为这能提供直观且全面的信息,帮助理解蛋白质的功能。基质辅助激光解吸/电离质谱成像(MALDI MSI)是一种强大的工具,可用于表征生物分子的空间分布。由于飞行时间(TOF)质谱仪在高质量范围内的灵敏度较低且质量分辨率不足,传统的蛋白质组学方法通常会先使用胰蛋白酶将蛋白质切割成肽段(500–3500 Da)再进行检测。然而,现有的原位消化方法往往需要较长的消化时间(>2小时),并且容易发生分子扩散,从而导致内在空间信息的丢失。本研究提出了一种快速的原位胰蛋白酶消化方法,该方法使用了我们自主研发的自动超声基质喷雾器SoniCoat。在用SoniCoat处理的胰蛋白酶进行消化后,组织直接被α-氰基-4-羟基肉桂酸(CHCA)包被,无需孵育过程。结果表明,与传统基于孵育的方法和商业设备相比,该方法产生了更多的肽信号。此外,该方法还能获得高质量图像,且不会出现分子扩散现象。该协议随后被应用于肝癌的小鼠模型,揭示了病变区域与健康区域之间蛋白质的空间分布差异。我们的方法有望为癌症诊断中蛋白质生物标志物的发现提供支持。

可视化生物组织切片中蛋白质的空间分布对于蛋白质组学分析至关重要,因为这能提供直观且全面的信息,帮助理解蛋白质的功能。基质辅助激光解吸/电离质谱成像(MALDI MSI)是一种强大的工具,可用于表征生物分子的空间分布。由于飞行时间(TOF)质谱仪在高质量范围内的灵敏度较低且质量分辨率不足,传统的蛋白质组学方法通常会先使用胰蛋白酶将蛋白质切割成肽段(500–3500 Da)再进行检测。然而,现有的原位消化方法往往需要较长的消化时间(>2小时),并且容易发生分子扩散,从而导致内在空间信息的丢失。本研究提出了一种快速的原位胰蛋白酶消化方法,该方法使用了我们自主研发的自动超声基质喷雾器SoniCoat。在用SoniCoat处理的胰蛋白酶进行消化后,组织直接被α-氰基-4-羟基肉桂酸(CHCA)包被,无需孵育过程。结果表明,与传统基于孵育的方法和商业设备相比,该方法产生了更多的肽信号。此外,该方法还能获得高质量图像,且不会出现分子扩散现象。该协议随后被应用于肝癌的小鼠模型,揭示了病变区域与健康区域之间蛋白质的空间分布差异。我们的方法有望为癌症诊断中蛋白质生物标志物的发现提供支持。
