Litorerythrobacter xanthomarinus（新属新种），一种具有独特表型特征的新型海洋细菌，发现于潮间带泥滩沉积物中

《Antonie van Leeuwenhoek》：Litorerythrobacter xanthomarinus gen. nov., sp. nov., a novel marine bacterium with distinct phenotypic traits from tidal mudflat sediment

从韩国Gunsan潮间泥沙中分离出革兰氏阴性、需氧、非运动性卵圆形菌 strain MF3-039^T，形成黄色菌落，过氧化氢酶和氧化酶阳性，最适生长条件为25℃、pH7.0、2% NaCl。16S rRNA基因分析显示与Altererythrobacter属近缘，但基因组比较（平均核苷酸相似性<95%，数字DNA-DNA杂交<70%）及化学分类（主要呼吸醌为ubiquinone-10，特征脂肪酸和极性脂类）确认其属种地位为新属Litorerythrobacter xanthomarinus，模式菌株为MF3-039^T。

　　

摘要

一种革兰氏阴性、需氧、不动的卵形细菌，被命名为MF3-039^T，是从韩国群山市的潮间带泥滩沉积物中分离出来的。该菌在海洋琼脂上形成黄色菌落，并且对过氧化氢酶和氧化酶呈阳性反应。其生长温度范围为10至37°C（最适温度为25°C），pH值范围为6.0至9.0（最适pH值为7.0），NaCl浓度范围为0至7.0%（w/v）（最适浓度为2.0%）。通过对16S rRNA基因序列的系统发育分析，发现MF3-039^T属于Altererythrobacter属（Erythrobacteraceae科），与Altererythrobacter insulae KCTC 63421^T（97.9%）、Altererythrobacter ishigakiensis ATCC BAA-2084^T（97.9%）、Altererythrobacter rubellus NBRC 112769^T（97.2%）以及Tsuneonella suprasediminis KCTC 62388^T（97.1%）的序列相似度最高。该菌的草图基因组大小为2.9 Mbp，G+C含量为60%。基因组比较显示，其与相关Altererythrobacter物种的平均核苷酸同源性以及DNA-DNA杂交值分别低于95%和70%。化学分类学分析表明，其主要呼吸醌为泛醌-10；C_17:1 ω6c和C_18:1 ω7c/C_{18:1 ω6c为主要的脂肪酸；二磷酸甘油、磷脂乙醇胺、磷脂甘油、磷脂胆碱、鞘糖脂、一种未鉴定的糖脂以及一种未鉴定的脂质为主要的极性脂质。这些表型、化学分类学、基因组学和系统发育学特征的组合使得MF3-039^T明显区别于Erythrobacteraceae科中的其他属。基于这些多相分析结果，MF3-039^T代表了一个新的属和种，建议将其命名为 gen. nov., sp. nov>。模式菌株为MF3-039^T（= KEMB 23948^T = KCTC 8705^T = TBRC 19385^T）。}

一种革兰氏阴性、需氧、不动的卵形细菌，被命名为MF3-039^T，是从韩国群山市的潮间带泥滩沉积物中分离出来的。该菌在海洋琼脂上形成黄色菌落，并且对过氧化氢酶和氧化酶呈阳性反应。其生长温度范围为10至37°C（最适温度为25°C），pH值范围为6.0至9.0（最适pH值为7.0），NaCl浓度范围为0至7.0%（w/v）（最适浓度为2.0%）。通过对16S rRNA基因序列的系统发育分析，发现MF3-039^T属于Altererythrobacter属（Erythrobacteraceae科），与Altererythrobacter insulae KCTC 63421^T（97.9%）、Altererythrobacter ishigakiensis ATCC BAA-2084^T（97.9%）、Altererythrobacter rubellus NBRC 112769^T（97.2%）以及Tsuneonella suprasediminis KCTC 62388^T（97.1%）的序列相似度最高。该菌的草图基因组大小为2.9 Mbp，G+C含量为60%。基因组比较显示，其与相关Altererythrobacter物种的平均核苷酸同源性以及DNA-DNA杂交值分别低于95%和70%。化学分类学分析表明，其主要呼吸醌为泛醌-10；C_17:1 ω6c和C_18:1 ω7c/C_{18:1 ω6c为主要的脂肪酸；二磷酸甘油、磷脂乙醇胺、磷脂甘油、磷脂胆碱、鞘糖脂、一种未鉴定的糖脂以及一种未鉴定的脂质为主要的极性脂质。这些表型、化学分类学、基因组学和系统发育学特征的组合使得MF3-039^T明显区别于Erythrobacteraceae科中的其他属。基于这些多相分析结果，MF3-039^T代表了一个新的属和种，建议将其命名为 gen. nov., sp. nov>。模式菌株为MF3-039^T（= KEMB 23948^T = KCTC 8705^T = TBRC 19385^T）。}