欧洲赤松（Pinus sylvestris）针叶中的真菌多样性和组成受到宿主基因型以及种子园位置的影响

《European Journal of Forest Research》：Fungal diversity and composition in Pinus sylvestris needles are influenced by host genotype and seed orchard location

本研究分析了爱沙尼亚八个种子林中12个云杉克隆针叶的真菌微生物群，发现基因型和地理位置均显著影响群落结构。克隆102、E44、T20的总体多样性和病原菌多样性较低，可能更具抗逆性；而克隆168-1、63、519病原多样性较高，需进一步试验评估。结果揭示了基因型对叶部真菌群落多样性的影响。

　　

摘要

欧洲松（Pinus sylvestris）在其原产地既维持了生态系统的稳定性，也具有经济价值。气候变化扰乱了与其相关的微生物群落，改变了病原体的分布。这种树木的微生物群落在树木的健康和抗逆性中起着关键作用，有助于增强其对生物和非生物压力的适应能力；因此，识别出能够抵抗这些生物和非生物压力的欧洲松基因型至关重要。本研究分析了爱沙尼亚八个种子园中十二个欧洲松克隆体的一年生针叶中的真菌微生物群落，探讨了果园位置和松树基因型（克隆体）是否会影响真菌群落的多样性和组成。从每个克隆体的针叶中提取DNA，并使用针对ITS1-5.8 S-ITS2区域的PCR技术进行扩增。测序得到了516,837条高质量的ITS序列和918个操作分类单元（OTUs），物种鉴定准确率为98%。子囊菌门和担子菌门是主要菌门，其中病原菌占比显著。克隆体102、E44和T20在一年生针叶中表现出最高的真菌α多样性以及最低的病原体α多样性，这表明它们可能是未来林业中具有抗逆性的基因型。克隆体168-1、63和519则含有最高的病原体α多样性，因此需要通过后代试验来验证这些基因型是否适合用于未来的林业用途。大多数地点和克隆体的真菌群落组成呈现相似趋势，而ANOOSIM和PERMANOVA分析证实了地点和基因型对真菌群落组成的显著影响。在12个树克隆体中，有9个的总体真菌α多样性相似，而在不同种子园中的12个克隆体中，有7个的病原体α多样性相似。这表明欧洲松克隆体在不同地点可能保持特定的真菌α多样性，说明基因型可能对叶片微生物群落有影响。本研究得出结论：地点影响真菌微生物群落的结构，而松树基因型影响真菌α多样性。

欧洲松（Pinus sylvestris）在其原产地既维持了生态系统的稳定性，也具有经济价值。气候变化扰乱了与其相关的微生物群落，改变了病原体的分布。这种树木的微生物群落在树木的健康和抗逆性中起着关键作用，有助于增强其对生物和非生物压力的适应能力；因此，识别出能够抵抗这些生物和非生物压力的欧洲松基因型至关重要。本研究分析了爱沙尼亚八个种子园中十二个欧洲松克隆体的一年生针叶中的真菌微生物群落，探讨了果园位置和松树基因型（克隆体）是否会影响真菌群落的多样性和组成。从每个克隆体的针叶中提取DNA，并使用针对ITS1-5.8 S-ITS2区域的PCR技术进行扩增。测序得到了516,837条高质量的ITS序列和918个操作分类单元（OTUs），物种鉴定准确率为98%。子囊菌门和担子菌门是主要菌门，其中病原菌占比显著。克隆体102、E44和T20在一年生针叶中表现出最高的真菌α多样性以及最低的病原体α多样性，这表明它们可能是未来林业中具有抗逆性的基因型。克隆体168-1、63和519则含有最高的病原体α多样性，因此需要通过后代试验来验证这些基因型是否适合用于未来的林业用途。真菌群落组成在大多数地点和克隆体中呈现相似趋势，而ANOOSIM和PERMANOVA分析证实了地点和基因型对真菌群落组成的显著影响。在12个树克隆体中，有9个的总体真菌α多样性相似，而在不同种子园中的12个克隆体中，有7个的病原体α多样性相似。这表明欧洲松克隆体在不同地点可能保持特定的真菌α多样性，说明基因型可能对叶片微生物群落有影响。本研究得出结论：地点影响真菌微生物群落的结构，而松树基因型影响真菌α多样性。