宿主N-糖基化成熟在EPEC感染中的双重作用:N-连接poly-LacNAc介导BFP黏附并促进T3SS效应蛋白转运

《Cell Reports》:Dual roles of host N-glycosylation in enteropathogenic Escherichia coli infection

【字体: 大 中 小 】 时间:2026年10月01日 来源:Cell Reports 7.7

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  宿主因子决定病原体嗜性,但促进肠致病性大肠杆菌(enteropathogenic Escherichia coli, EPEC)感染的宿主基因知识有限。为鉴定EPEC感染所需的宿主决定因素,研究人员开展了两个独立的基因组规模CRISPR-Cas9筛选。两者均汇

宿主因子决定病原体嗜性,但促进肠致病性大肠杆菌(enteropathogenic Escherichia coli, EPEC)感染的宿主基因知识有限。为鉴定EPEC感染所需的宿主决定因素,研究人员开展了两个独立的基因组规模CRISPR-Cas9筛选。两者均汇聚于宿主N-糖基化(N-glycosylation)是感染的关键需求。对N-聚糖成熟(N-glycan maturation)的遗传或药理学抑制表明,N-糖基化通过两条不同途径促进感染。第一,N-连接多聚-N-乙酰乳糖胺(N-linked poly-N-acetyllactosamine, poly-LacNAc)聚糖作为EPEC主要黏附素束状菌毛(bundle-forming pilus, BFP)的受体。第二,N-糖基化扰动损害宿主膜结构,导致III型分泌系统(type III secretion system, T3SS)活性降低,且独立于宿主细胞黏附。利用人结肠和空肠类器官来源的上皮单层,研究人员进一步表明,EPEC黏附与末端甘露糖暴露呈负相关,提示聚糖组成可能参与决定肠道嗜性。总之,这些发现确立宿主N-聚糖成熟是肠道感染期间被利用的关键宿主途径。
研究背景方面,EPEC引起婴儿腹泻,尤其在低中收入国家,可严重甚至致死,并可在暴发和散发中出现。EPEC属于诱导“黏附与消失”(attaching and effacing, AE)病变的病原体,特征为微绒毛消失、细菌紧密黏附和附着细菌下方形成富含肌动蛋白的“基座”(actin pedestals)。其感染包括多个步骤:初期黏附由束状菌毛(bundle-forming pilus, BFP)介导,随后EPEC利用III型分泌系统(type III secretion system, T3SS)注入效应蛋白(effector proteins),干扰细胞骨架、囊泡运输、信号转导和细胞周期。Tir是首个注入的T3SS效应蛋白,在宿主膜内形成发夹结构并与intimin结合,导致紧密黏附并招募N-WASP和Arp2/3复合物形成肌动蛋白基座。研究人员近期表明,EPEC过表达小RNA(small RNA, sRNA)MgrR(Mg2+-responsive RNA)可变得超毒,部分通过抑制CesT实现。许多EPEC-宿主互作仍未知,因此需要鉴定感染所需宿主因子。

研究人员开展了两个独立的全基因组CRISPR-Cas9筛选,分别基于宿主细胞毒性和Tir-intimin相互作用,发现多个宿主途径,包括肌动蛋白细胞骨架、基因表达调控和糖基化。两项筛选均将多聚-N-乙酰乳糖胺(poly-N-acetyllactosamine, poly-LacNAc)糖基化途径列为重要命中,提示该途径是EPEC感染性的关键决定因素。研究表明,LacNAc糖基化既为BFP介导的黏附所需,也为高效T3SS效应蛋白转位所需;人结肠和空肠类器官感染显示,空肠优先黏附与组织表面聚糖相关。该研究强调N-糖基化在EPEC感染中的复杂作用,为抗腹泻病抗毒力策略提供基础。

关键技术方法(不超过250字):研究人员开展两个独立全基因组CRISPR-Cas9筛选:毒性筛选使用Avana sgRNA文库转导HT-29细胞,感染超毒EPEC/pMgrR,经四轮富集后测序并以MAGeCK分析;Tir转位筛选使用Brunello文库转导K562细胞,以EPEC Δeae感染,再用表达intimin和GFP的E. coli K12标记表面Tir,经FACS分选高、低GFP群体。随后使用MGAT1敲除HeLa、kifunensine处理、LDH毒性检测、流式细胞术、免疫荧光、split nanoluciferase效应蛋白转位检测、NHS-biotin表面蛋白质组学与LC-MS/MS。人结肠和空肠类器官来源于University Hospital of Würzburg生物样本库,伦理批准37/16,并获得知情同意。

结果部分保留各小标题并浓缩如下。

两个CRISPR筛选鉴定宿主N-糖基化为EPEC感染的核心需求:毒性筛选以EPEC/pMgrR感染Avana文库转导的HT-29细胞,四轮富集后比较gRNA丰度,获得数十个显著富集基因;Tir转位筛选以EPEC Δeae感染Brunello文库转导的K562细胞,用表达intimin和GFP的E. coli K12标记表面Tir,FACS分选低、高GFP群体,低GFP群体富集感染所需基因。两个筛选共同命中B3GNT2,其编码β-1,3-N-乙酰葡糖氨基转移酶,参与poly-LacNAc合成。毒性筛选还命中MGAT1、SLC35A2和TMEM165,后者为高尔基Mn2+/Ca2+转运体,调节N-糖基化酶所需锰供应。MGAT2和MGAT5也在LacNAc生物合成相关基因中出现。

MGAT1敲除细胞对EPEC毒性抵抗增加:研究人员靶向MGAT1,因其催化N-糖蛋白甘露糖残基添加N-乙酰葡糖胺(N-acetylglucosamine, GlcNAc),是N-连接poly-LacNAc生成前提。HeLa MGAT1敲除经测序、western blotting和免疫荧光确认。EPEC/pMgrR感染后,野生型HeLa细胞毒性约70%,MGAT1敲除细胞约35%,验证MGAT1贡献EPEC毒性易感性。

MGAT1敲除改变细胞表面聚糖结构:MGAT1缺失预期消除LacNAc并增加末端甘露糖展示。流式细胞术显示MGAT1敲除细胞刀豆蛋白A(concanavalin A, ConA)结合增加,小麦胚芽凝集素(wheat germ agglutinin, WGA)染色减少。1:1混合野生型和敲除细胞后,抗MGAT1和ConA双染显示敲除细胞缺乏核周MGAT1信号且ConA染色显著升高,提示表面聚糖可能参与EPEC感染。

EPEC微菌落对MGAT1敲除细胞黏附减少:1:1混合感染野生型EPEC后,感染1–1.5 h时MGAT1敲除细胞上微菌落黏附减少;2–2.5 h差异减弱。T3SS缺陷株ΔescRSTU仅通过BFP黏附,其黏附在2 h仍低,补回MGAT1后恢复。外源可溶性LacNAc抑制野生型HeLa细胞黏附至类似MGAT1敲除水平,支持表面末端LacNAc是BFP受体。

BFP和I型菌毛对野生型和MGAT1敲除细胞的反向黏附:BFP缺陷株ΔbfpA对MGAT1敲除细胞黏附呈双峰,与I型菌毛(type I fimbriae, T1F)相变相关。PCR显示T1F-ON状态与对MGAT1敲除细胞广泛黏附强相关;补回MGAT1恢复低T1F结合。D-甘露糖显著降低ΔbfpA T1F-ON对MGAT1敲除细胞黏附,对野生型低黏附影响小。结果表明LacNAc缺失暴露甘露糖,使T1F介导补偿性黏附,绕过BFP功能丧失。

MGAT1通过依赖黏附和不依赖黏附机制增强T3SS效应蛋白转位:使用split nanoluciferase检测,MGAT1敲除细胞中EspF和EspG转位减少,与基座形成减少相关。BFP和T1F双缺陷株ΔbfpA Δfim对野生型和敲除细胞黏附相等且低,但敲除细胞仍形成显著更少肌动蛋白基座,EspF转位减少,说明T3SS活性受损独立于细菌结合。MGAT1依赖的N-糖基化通过两种机制支持感染:提供BFP受体增强黏附和后续T3SS转位;独立于黏附进一步增强T3SS活性。

MGAT1缺失广泛重塑宿主细胞表面蛋白质组:N-糖基化对高尔基介导蛋白分选和膜运输关键。NHS-biotin表面标记后质谱显示,MGAT1敲除细胞表面蛋白质组显著改变。细胞黏附与细胞外相互作用、膜域组织、细胞骨架组织相关蛋白强烈减少,包括LGALS3(galectin-3)、ITGA4、ITGA7、ICAM1、MCAM、BCAM和CAVIN1。MGAT1缺失广泛损害宿主膜微域完整性,而EPEC T3SS转位子插入需要该环境。CRISPR筛选命中的ARPC4、SPTBN1和CTNND1膜相关水平也降低。

Kifunensine处理表型模拟MGAT1敲除:kifunensine抑制内质网甘露糖苷酶I(ER mannosidase I, Man1),影响甘露糖修剪和MGAT1活性。处理HeLa和HT-29细胞后ConA染色增加,EPEC黏附显著减少,split nanoluciferase和基座形成显示T3SS活性在依赖和不依赖黏附方式下受抑制。干扰N-聚糖成熟破坏EPEC感染多个阶段。

人肠道类器官中凝集素异质性与EPEC黏附相关:人结肠和空肠类器官来源2D单层中,EPEC可黏附并注入效应蛋白形成基座。ConA染色显示细胞间表面聚糖异质性:结肠单层多数细胞强染色,空肠多数低染色,仅小亚群强染色。EPEC微菌落主要与低ConA染色细胞相关,呈负相关。12个独立分离EPEC野生型菌落均为T1F-OFF,提示主要BFP介导。内源N-聚糖呈递变异可调节宿主易感性;结肠高ConA细胞较多,提示人肠道区域糖基化差异可能贡献EPEC组织嗜性。

讨论部分总结:两个独立宿主靶向遗传筛选鉴定EPEC感染所需因子,poly-LacNAc N-糖基化途径基因在两项筛选中均居前。LacNAc是BFP黏附必需,扩展并加强先前观察。LacNAc生物合成破坏导致末端甘露糖暴露,强烈促进表达甘露糖结合T1F的EPEC相变体黏附;因此LacNAc介导黏附受损时,EPEC可通过上调T1F补偿。N-糖基化途径扰动还诱导宿主细胞表面蛋白质组广泛变化,反映其在高尔基蛋白分选中的作用,并与T3SS效应子递送减少相关,可能因丢失最佳T3SS停靠所需宿主表面因子。人肠道类器官证据提示,肠道内细胞表面糖基化变异可能贡献EPEC组织嗜性。临床研究强调BFP重要性;人实验感染中bfpA突变和BFP调节子perA突变症状显著少于野生型;非典型EPEC缺乏BFP增加但病情较轻;70个分离株分析中致死病例仅与表达BFP的典型EPEC相关。可溶性LacNAc或LacNAc-BSA可抑制BFP依赖黏附,使LacNAc或LacNAc与甘露糖混合物成为潜在抑制剂。研究结果提示N-糖基化除形成受体外,还通过调节膜相关蛋白质组维持宿主膜功能景观。研究人员推测MGAT1敲除中CAVIN1、整合素和galectin-3耗竭导致特化膜微域崩溃,为T3SS效应子递送减少提供合理解释。表面蛋白质组结果提示N-糖基化还调节CRISPR筛选命中宿主因子如ARPC4、SPTBN1、CTNND1的膜关联。不能排除特定N-糖基化蛋白为EPEC T3SS活性所需,例如副溶血弧菌T3SS2转位子插入需要宿主细胞表面岩藻糖化聚糖。EPEC偏好婴儿小肠,但组织嗜性机制仅部分理解。ConA染色显示结肠类器官比空肠强,提示结肠上皮甘露糖富集聚糖较多、末端LacNAc结构较少,EPEC黏附在结肠单层显著减少;少数黏附微菌落位于ConA弱染色区域。这些发现提示空肠复杂聚糖丰度较高可能贡献EPEC偏好定植小肠。所有12个独立分离EPEC野生型菌落均为T1F-OFF,类器官黏附模式最符合BFP识别含LacNAc聚糖而非T1F依赖结合。除糖基化外,肌动蛋白调控基因在筛选中突出,多数Arp2/3复合物组分及CDC42、WASL在毒性筛选富集;Tir转位筛选鉴定ACTR10和AIF1L,后者先前与志贺菌T3SS介导的肌动蛋白重排相关。其他命中包括KMT2D、ZNF619、STK11和STK17B,其机制作用仍需验证和阐明。局限性指出,研究使用培养上皮细胞和人肠道类器官,不能完全复现肠道环境复杂性;缺乏稳健EPEC感染动物模型,使宿主N-糖基化对感染和组织嗜性的贡献仍具挑战。

研究结论翻译:总之,研究人员的结果确立宿主N-糖基化是EPEC感染的核心决定因素。除确认其在细菌黏附中的作用外,这项工作揭示N-糖基化对有效T3SS效应子递送必不可少,并可能参与EPEC对小肠的组织嗜性。这些见解扩展了对宿主-病原体相互作用的理解,并为靶向宿主糖基化途径以调节细菌毒力开辟新途径。

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