日本列岛沿海鱼类高频环境DNA宏条形码数据集:覆盖211个采样点的多时间尺度生物多样性调查
《Scientific Data》:High-frequency eDNA metabarcoding survey data of coastal fish across the Japanese Archipelago
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时间:2026年10月02日
来源:Scientific Data 7.2
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摘要
日本列岛横跨超过3,000公里,从亚北极带延伸至亚热带地区(约北纬24°至45°),拥有由显著的纬度梯度所塑造的多样化沿海鱼类群落。本文提出了一套覆盖整个列岛采集的沿海鱼类高频环境DNA(eDNA)宏条形码数据集。我们使用靶向线粒体12S rRNA基因高变区的MiFi
摘要日本列岛横跨超过3,000公里,从亚北极带延伸至亚热带地区(约北纬24°至45°),拥有由显著的纬度梯度所塑造的多样化沿海鱼类群落。本文提出了一套覆盖整个列岛采集的沿海鱼类高频环境DNA(eDNA)宏条形码数据集。我们使用靶向线粒体12S rRNA基因高变区的MiFish引物组,在211个点位开展调查,通过单次(年度)、每月一次和每两周一次的采样方案共采集了690个样本。高频采样的引入使得能够检测鱼类群落组成的精细时间变化。从2018年1月至2019年3月,采集了eDNA样本及其地理与环境变量的元数据,包括海岸结构、波高、潮汐、水流和水温。最终数据集包含跨171科的1,477个物种的鱼类eDNA记录。该数据集为研究日本列岛沿海生态系统的鱼类群落结构、时间动态和生物多样性提供了宝贵的资源,支持生态学、保护生物学以及基于eDNA的多种研究应用。
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