综述:无菌与有定菌鱼类模型:方法学、局限性与标准化实践综述
《Microbiology Research》:Axenic and Gnotobiotic Aquatic Models: Methods, Husbandry, and Applications
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时间:2026年10月03日
来源:Microbiology Research 2.5
摘要
无菌和有定菌水生动物的研究为微生物在宿主生理、营养、免疫和疾病中的因果作用提供了直接的实验途径。鱼类是尤为适合的脊椎动物模型,因为其受精和胚胎发育通常发生在体外,使得胚胎可在孵化前进行消毒,并在微生物可控的条件下进行饲养。目前的研究方法结合了胚胎或卵的表面消毒、无菌水和培养系统、灭菌配合饲料或无菌活体饲料,以及与特定微生物的受控定植。这些系统能够直接检测微生物对免疫、代谢、病原体抗性和营养反应的影响。然而,其解释受到污染风险、物种和发育阶段特异性饲养需求、灭菌引起的饲料和水化学变化、低生物量无菌检测的局限性,以及长期微生物缺失可能带来的混杂效应等因素的限制。目前,斑马鱼(Danio rerio)是研究最多、最成熟的无菌或有定菌鱼类模型,但青鳉(Oryzias latipes)以及养殖鱼类如虹鳟(Oncorhynchus mykiss)、欧洲鲈(Dicentrarchus labrax)和大西洋鳕鱼(Gadus morhua)也已有相应方法建立。本叙述性综述评估了无菌水生动物的研究在实际操作和概念基础方面的内容,重点关注鱼类的生产、饲养和处理。该文比较了代表性的培养制备程序、无菌培养方式、饲喂策略、水质限制条件及无菌检测方法,并探讨了这些方法学选择如何影响生物学解读。一个核心结论是,"无菌"是一个操作性的微生物状态,而非绝对的生物学属性,因为其置信区间取决于采样设计和正交检测方法。因此,该综述提出了最低限度的报告和质量控制实践,包括容器级重复实验、纵向无菌检测、饲料验证、污染判定规则以及适当的再定植对照。如果无菌或有定菌水生模型要产生可重复的机制性研究结果,这些标准至关重要。未来的进展将依赖于标准化的验证和报告标准、改进的无菌营养方案、水质管理以及更长期的饲养系统。
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