单核RNA测序揭示高级别浆液性卵巢癌早期复发相关的免疫调节生态位——干性CD8+ T细胞、SPP1+巨噬细胞与CD47+上皮细胞的协调富集与空间互作

《Cell Communication and Signaling》：Single-nucleus transcriptomics reveals an early-relapse-associated epithelial–myeloid–T cell niche in advanced high-grade serous ovarian cancer

摘要

早期复发仍是晚期高级别浆液性卵巢癌（HGSOC）的主要临床挑战，但与复发时间相关的肿瘤微环境特征仍未明确定义。在此，我们对晚期 HGSOC 患者的未经治疗肿瘤进行了单核 RNA 测序（snRNA-seq）分析，包括短无病生存期组（STDFS，n?=?4）和长无病生存期组（LTDFS，n?=?6），共分析了 120,495 个细胞核。对细胞组成、转录程序和细胞间通讯的整合分析，并由独立队列（n?=?41）中的 TCGA-OV 转录组 RNA 测序和多重免疫荧光（mIF）进行验证补充。STDFS 肿瘤显示出干性 CD8⁺ T 细胞、SPP1⁺ 巨噬细胞和 CD47⁺ 上皮细胞的协调富集。配体 - 受体推断预测这些群体之间的通讯增强，包括 SPP1-整合素和 CD47-SIRPA 信号传导，而基于 mIF 的空间分析证实了它们在 STDFS 肿瘤中的邻近性增加。在 TCGA-OV 和验证队列中，这些细胞状态（无论是单独还是联合）的较高丰度均与较短的无病生存期（DFS）相关。总之，这些发现确定了一个与复发相关的免疫调节生态位，其特征是干性 CD8⁺ T 细胞、SPP1⁺ 巨噬细胞和 CD47⁺ 上皮细胞的协调积累和空间组织，为理解早期复发和精炼晚期 HGSOC 的预后生物标志物发现提供了转录组学和空间框架。