瘤内双歧杆菌丰度降低与肝细胞癌术后极早期复发相关：基于131例患者的微生物组与转录组研究

《BMC Medicine》：Intratumoral microbiota heterogeneity and Bifidobacterium abundance are linked to very early recurrence in hepatocellular carcinoma

摘要

背景

虽然肝细胞癌 (HCC) 中存在瘤内细菌已有报道，但 HCC 与邻近非肿瘤组织之间的组成差异仍存在争议，且与术后极早期复发相关的具体分类群尚未得到探索。

方法

我们收集了 131 例 HCC 患者的肿瘤组织及配对正常组织，进行 16S 核糖体 RNA (rRNA) 测序。采用多种生物信息学方法比较了肿瘤组织与正常组织之间的微生物组成、多样性及富集分类群。还比较了发生术后极早期复发 (VER) 的 HCC 患者与未发生 VER 患者的瘤内微生物组。对 Bifidobacterium 丰度高与低的 HCC 组织进行转录组测序，以识别差异表达基因和通路，并进行免疫细胞谱分析。利用荧光原位杂交 (FISH)、终末脱氧核苷酸转移酶介导的 dUTP 缺口末端标记 (TUNEL) 和免疫组织化学，评估了 Bifidobacterium 的存在/丰度与凋亡信号通路以及凋亡相关标志蛋白之间的关联。

结果

HCC 与正常组织之间的微生物多样性无差异，但存在明显的组成差异和个体间异质性。在分类水平上，肿瘤组织、邻近组织和胆汁中的细菌组成大幅重叠。与未发生 VER 的患者相比，VER 患者的瘤内 Bifidobacterium 丰度显著降低。FISH 证实了瘤内存在 Bifidobacterium。Bifidobacterium 富集与凋亡活性增强、杆状病毒 IAP 重复序列结合蛋白 5 (BIRC5) 表达降低相关，并与 TUNEL 染色和剪切后的 Caspase-3 染色结果一致。

结论

瘤内 Bifidobacterium 丰度降低与 HCC 的术后极早期复发相关，尽管这一发现仍需通过多中心队列进行验证。