马来西亚β-地中海贫血谱系回顾性分析及新突变发现

《Scientific Reports》：A nationwide molecular characterization of β-thalassemia and variants among a referred trio families in Malaysia

　　

摘要

地中海贫血是马来西亚的重大健康负担。本报告对过去七年收集的全国诊断数据进行了回顾性分析，调查了731个转诊家庭三联体的β-地中海贫血谱。基因组分析采用了gap-PCR、ARMS-PCR、MLPA、Sanger测序和外显子组测序来验证罕见的拷贝数变异（CNVs）。我们确定了468对高风险夫妇，其中440名儿童继承了双等位基因突变。在半岛马来西亚儿童中记录了异质性突变，包括43个β-、4个δ-、11个α-地中海贫血和变异类型，以及5个α-珠蛋白重复。在沙巴的儿童中，记录了15个β-、1个δ-、2个α-地中海贫血和变异，以及1个α-珠蛋白重复。砂拉越表现出最低的异质性。在半岛马来西亚，β^E在马来人中最为普遍，其次是IVS 1–5 (G > C)、β^Malay和IVS 1–1 (G > T)。IVS 2–654 (C > T)和?28 (A > G)仅在该转诊队列的中国人中观察到，而Cd 41/42 -TTCT在两个民族中都很常见。β^E/β-地中海贫血是最常见的疾病，有188例。在沙巴，纯合β^Filipino是多个民族中最常见的基因型，其中35.2% (31/88)的这些病例同时表现出-α^3.7。总体而言，15.2% (111/731)的HBB突变儿童同时患有α-地中海贫血，10名儿童有α-三倍体。这些发现强调了HBA基因分型对于准确遗传咨询的必要性。我们报告了两个新的突变，密码子122 (TTC > TGC)突变（HBB:c.368 T > G; p.Phe123Cys）命名为β^{Tanah Merah}，以及α-珠蛋白簇重复，ααα⁹¹ (NC_000016.10:g.87820_179080dup)。这个全面的数据集对于改进分子诊断和优化高度异质人群中的DNA分析工作流程至关重要。