欧洲临床宏基因组下一代测序实验室自建检测的监管框架现状与挑战综述

《Journal of Microbiological Methods》：The regulatory landscape for clinical metagenomics-based diagnostics in Europe: a critical review

摘要

宏基因组下一代测序（mNGS）能够实现广泛且非针对性的病原体检测，并越来越多地用于中枢神经系统感染、免疫受损或移植后患者感染、重症监护室（ICU）患者以及脓毒症的诊断。mNGS 日益增长的临床作用使得围绕其的监管环境成为一个亟待评估的主题，尤其是考虑到欧洲体外诊断法规（IVDR）的分阶段实施。从体外诊断指令（IVDD）向 IVDR 的转变标志着欧洲经济区（EEA）内体外诊断向协调一致的、基于风险的框架转变，但对于临床 mNGS 等复杂的实验室自建检测（LDT），仍有几个方面尚不明确——包括第 5 条第 5 款下医疗机构豁免的实际实施、广泛 mNGS 检测在当前风险等级中的分类，以及所需的分析和临床验证范围。值得注意的是，mNGS 的验证策略可能需要侧重于整体分析方法和使用目的，而不是针对单个目标病原体。其他优先事项包括协调一致的质量要求、更广泛的外部质量评估（EQA）可用性，以及更清晰的机构间验证方案转移框架。本综述批判性地评估了当前欧洲针对基于临床 mNGS 的 LDT 的监管框架，并确定了需要进一步明确的领域。医疗机构、监管机构、科学学会和行业之间的持续合作将至关重要，以在保持要求适度的同时，支持 mNGS 在常规诊断中安全、可靠且具有临床实用价值的实施。

Tarek Badr|Khaled Hatem

弗莱堡大学医学微生物学与卫生学研究所，弗莱堡大学医学中心，弗莱堡大学医学院，德国弗莱堡