《Nature Aging》:Decline of chaperone-mediated autophagy in aging impairs macrophage clearance of senescent cells
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自噬(autophagy)功能障碍和细胞衰老(cellular senescence)是公认的衰老驱动因素,但二者之间潜在的相互作用仍知之甚少。研究人员发现,衰老相关的分子伴侣介导的自噬(chaperone-mediated autophagy, CMA)下降
自噬(autophagy)功能障碍和细胞衰老(cellular senescence)是公认的衰老驱动因素,但二者之间潜在的相互作用仍知之甚少。研究人员发现,衰老相关的分子伴侣介导的自噬(chaperone-mediated autophagy, CMA)下降,即一种选择性溶酶体蛋白降解途径的下降,会改变衰老细胞特性并损害其免疫清除。CMA缺陷细胞虽发生衰老,但获得类似衰老生物体中衰老细胞的蛋白质组、代谢和分泌特征。其衰老相关分泌表型(senescence-associated secretory phenotype, SASP)对邻近细胞表现出增强的促衰老效应,并抑制巨噬细胞CMA,从而损害巨噬细胞吞噬衰老细胞的能力。相应地,在巨噬细胞中特异性阻断CMA会增加小鼠体内衰老细胞积累,并延迟伤口愈合过程中的衰老消退。相反,药理学激活CMA可减少老年小鼠的衰老细胞负荷,并减轻肺纤维化小鼠模型的疾病严重程度。研究人员的发现确定CMA下降是衰老细胞持续存在的驱动因素,并强调上调CMA是促进老年生物体衰老消退的有前景策略。
衰老由多种细胞和机体过程失败驱动,包括蛋白质稳态丧失、自噬功能障碍和细胞衰老,但三者之间的交互仍不清楚。自噬缺陷可加速实验模型中的衰老表型并加重年龄相关疾病;衰老细胞在器官中随年龄积累并促进疾病发生。CMA是选择性溶酶体降解含KFERQ样基序蛋白的途径,底物由胞质分子伴侣热休克同源蛋白71 kDa(HSC70)识别并递送至溶酶体相关膜蛋白2A(LAMP2A)受体。CMA随年龄在多数组织中下降,并与神经退行性疾病、衰老代谢综合征和动脉粥样硬化相关。此前研究报道CMA在衰老建立时上调,但其功能相关性以及年龄相关CMA下降如何影响衰老仍未知。年轻生物体中衰老细胞可被免疫细胞清除,尤其巨噬细胞、树突状细胞、自然杀伤细胞和T细胞,但衰老时衰老细胞逃避免疫清除;巨噬细胞CMA功能障碍与疾病进展相关,但其对衰老细胞清除的影响未知。因此,研究人员聚焦CMA在衰老建立、维持和免疫消退中的作用,发现老年细胞在衰老诱导时无法上调CMA,导致分泌组发生重要改变;CMA缺失不诱导衰老,但可表型模拟老年衰老细胞特征;异常SASP增强促衰老作用并抑制巨噬细胞CMA和胞葬;巨噬细胞CMA缺失增加小鼠衰老细胞积累、延迟伤口愈合并损害吞噬;药理学激活CMA减少老年小鼠多组织衰老细胞负荷并缓解肺纤维化。该研究确定CMA下降是衰老细胞持续存在的驱动因素,并支持上调CMA作为促进老年机体衰老消退的策略。论文发表在《Nature Aging》。
关键技术方法不超过250字:研究使用KFERQ-Dendra2转基因报告小鼠、全身L2A
KO小鼠和巨噬细胞特异性LysMCre-L2A
?/?(ML2A
?/?)小鼠;原代小鼠耳成纤维细胞(mEFs)和骨髓来源巨噬细胞(BMDM);palbociclib等诱导衰老;定量蛋白质组学、代谢组学和分泌组分析,其中ER-TurboID用于区分常规与非常规分泌;溶酶体分离与CMA体外活性测定;单细胞RNA-seq;博来霉素肺纤维化模型、伤口愈合模型及CMA激活剂CA口服给药。人类肺组织来自OSU Comprehensive Transplant Center (CTC) Human Tissue Biorepository,包括健康供者和IPF患者。
研究结果:Blockage of CMA displays a senescence-like phenotype:通过KFERQ-Dendra报告和mEFs,发现23 m细胞基础CMA低且在palbociclib后不能上调;L2A
KD细胞在衰老诱导前已有SA-β-gal、核HMGB1、p21、γH2A.X和核内陷的部分变化,但增殖正常,衰老诱导后才停滞;PCA显示L2A
KD细胞介于对照和衰老对照之间。结论是CMA缺失不足以驱动常规衰老,但改变衰老反应。CMA loss phenocopies the proteome changes of aged senescent cells:比较年轻、老年对照和L2A
KO成纤维细胞蛋白质组,CMA阻断重现近半老年基础蛋白质组变化,衰老时4 m L2A
KO与23 m Ctrl有45%一致性;衰老诱导CMA降解组中,老年细胞多数CMA底物降解减少。结论是CMA缺失导致衰老时蛋白质组重塑缺陷。CMA regulates senescence-induced metabolic changes:代谢组显示CMA缺陷重现老年基础代谢变化;衰老后4 m L2A
KO和23 m Ctrl聚类不同于年轻对照,脂肪酸β氧化缺失,TCA循环、芳香族氨基酸和核苷酸代谢独特;整合分析显示CMA降解蛋白解释代谢差异,尤其脂肪酸和一碳代谢。结论是CMA缺失损害衰老代谢重编程。Deficient CMA alters senescence-associated secretory phenotype:ER-TurboID分泌组分析显示CMA阻断改变基础常规和非常规分泌;衰老后分泌谱显著不同,未完成完整SASP,免疫相关蛋白富集;条件培养基诱导旁分泌衰老。结论是CMA缺失导致分泌组失调和促衰老旁分泌效应。Impact of the secretome of CMA-deficient cells on the immune response to senescence:BMDM中老年CMA降低;衰老成纤维细胞分泌组抑制年轻巨噬细胞CMA,L2AKO更强;与ML2A
?/?巨噬细胞共培养增加衰老细胞持续,CMA缺陷衰老成纤维细胞对L2A
?/? BMDM有细胞毒性。结论是该分泌组损害巨噬细胞功能和存活。Loss of CMA in macrophages compromises phagocytosis:L2A
?/? BMDM自噬流未变但吞噬和胞葬下降;分泌组降低对照巨噬细胞吞噬,CA部分改善;机制为SIRPα溶酶体降解减少、SHP-1升高和actin细胞骨架改变。结论是CMA通过终止CD47-SIRPα“别吃我”信号促进吞噬。In vivo CMA loss in macrophages increases senescent cell burden:ML2A
?/?老年小鼠多组织SA-β-gal
+细胞增加、核HMGB1降低、p21和p53升高,肝单细胞RNA-seq显示SenNet签名增强,SHP-1和CD47增加,TUNEL
+细胞增加;伤口愈合延迟,p21
+细胞多。结论是巨噬细胞CMA缺失增加衰老细胞负荷并延迟修复。Chemical activation of CMA in aging reduces senescent cell burden:18 m小鼠口服CA 5个月,减少多组织SA-β-gal
+细胞和p21、Tnf、Il1α、p16
INK4A转录,减轻纤维化;CA处理老年BMDM恢复吞噬。结论是药理激活CMA减少衰老细胞负荷和纤维化。Activation of CMA reduces senescence and prevents development of lung fibrosis:人肺单细胞RNA-seq显示CMA评分随年龄下降,IPF降低,SPP1巨噬细胞和AT1细胞下降;IPF肺溶酶体L2水平低、底物摄取减少;小鼠肺成纤维细胞CMA随年龄下降;博来霉素模型中早期CA比晚期更有效,减少纤维化、Col1α1、p16
INK4A和F4/80
+巨噬细胞,并调节免疫。结论是早期CMA激活改善IPF严重程度并协调衰老细胞消除。
讨论部分总结:研究人员确定CMA是衰老细胞蛋白质组的主要调节因子,直接影响SASP组成;衰老诱导时未能上调CMA导致异常衰老程序、增强促衰老和免疫抑制/毒性SASP;巨噬细胞CMA缺失损害吞噬和胞葬,增加器官衰老细胞负荷;系统性CMA激活减少老年小鼠衰老细胞负荷并减轻肺纤维化,支持CMA作为治疗靶点。讨论还强调CMA不是衰老启动所必需,但CMA缺陷细胞的衰老程序类似老年细胞;代谢和囊泡运输缺陷导致异常SASP;CA效果具有组织特异性,肺中最强;局限包括主要使用成纤维细胞和palbociclib、LysM-Cre可能影响其他髓系细胞、人类肺数据为相关性并需患者验证。研究结论部分翻译:总体而言,研究人员的发现强调功能性CMA是衰老细胞消退所必需的,并证明增强CMA活性在衰老和衰老相关疾病如IPF中具有潜在益处。