巴西混血人群遗传性癌症综合征全基因组测序研究：诊断结果与临床表现相关而非遗传祖源或自述种族

《npj Genomic Medicine》：Whole-genome profiling of hereditary cancer risk in a highly admixed cohort from Northeast Brazil: clinical, genomic, and ancestry findings

摘要

遗传性癌症综合征占所有癌症的 5%–10%，但在包括巴西在内的许多中低收入国家，获取基因检测的途径仍然有限。在混血人群中，临床和人群因素对诊断结果的贡献仍知之甚少。本研究调查了 400 名遗传性癌症高风险个体的社会人口学、临床和基因组特征。这些个体在巴西巴伊亚州萨尔瓦多的一家常见病参考服务机构招募，并通过“巴西稀有基因组项目”接受了生殖系全基因组测序。参与者主要为女性（94.5%），自述为棕色人种（74.3%），且有乳腺癌个人病史（73.6%）。在 23% 的个体中发现了遗传性癌症相关基因的致病性或可能致病性变异，19% 的个体确立了明确的分子诊断。26% 的病例结果为不确定，55% 的病例未显示具有临床意义的变异。最常受影响的基因为 BRCA1、BRCA2、MUTYH、NF1、ATM 和 TP53，此外，一个深内含子 NF1 变异展示了全基因组测序检测相关非编码变异的能力。遗传祖源分析证实了该队列的混血背景，并显示不同自述种族组之间的祖源比例存在显著差异。然而，自述种族/族裔或遗传祖源均与诊断率或变异分类无关。诊断率随临床表现而异，在具有特征明确的综合征性疾病的个体中最高。这些发现表明，诊断结果与临床表现的关系更为密切，而非与遗传祖源或自述种族/族裔相关，这支持在公共卫生系统内更广泛地实施基因组医学。