基于活性导向分离与蛋白质组学联合鉴定肠道菌群衍生的结直肠癌抗增殖候选分子

《BMC Cancer》：Proteomic identification of secreted protein candidates mediating anti-colorectal cancer activity in a human-derived non-enterotoxigenic Bacteroides fragilis

摘要

肠道菌群衍生因子对结直肠癌（CRC）进展的贡献引起了越来越多的关注；然而，具体的生物活性成分及其潜在机制仍缺乏明确界定。本研究采用活性导向分离方法结合蛋白质组学分析，鉴定与结直肠癌细胞抗增殖活性相关的NTBF衍生成分。通过超滤、溶剂提取和色谱法对细菌条件培养基上清液进行连续分离，并在HT-29细胞中评估各分离组分的前增殖活性。随后对活性组分进行LC-MS/MS分析和生物信息学特征分析。比较蛋白质组学分析鉴定出41个与生物活性组分相关的候选蛋白。功能注释表明，这些蛋白主要参与铁的获取、ATP结合盒（ABC）转运系统和蛋白分泌途径。值得注意的是，大量蛋白被预测定位于外膜或含有信号肽，提示其可能在宿主-微生物相互作用中发挥作用，并可能与外膜囊泡等细胞外结构相关。这些蛋白应被视为与抗增殖组分相关的候选生物活性分子，而非已确认的功能效应因子。观察到的富集模式进一步提示，多种分子成分可能共同贡献了该生物活性，尽管这些候选分子的个体及联合功能作用仍需直接实验验证。总体而言，这些发现为系统鉴定与CRC抗增殖活性相关的菌群衍生候选分子提供了框架。

肠道菌群衍生因子对结直肠癌（CRC）进展的贡献引起了越来越多的关注；然而，具体的生物活性成分及其潜在机制仍缺乏明确界定。本研究采用活性导向分离方法结合蛋白质组学分析，鉴定与结直肠癌细胞抗增殖活性相关的NTBF衍生成分。通过超滤、溶剂提取和色谱法对细菌条件培养基上清液进行连续分离，并在HT-29细胞中评估各分离组分的抗增殖活性。随后对活性组分进行LC-MS/MS分析和生物信息学特征分析。比较蛋白质组学分析鉴定出41个与生物活性组分相关的候选蛋白。功能注释表明，这些蛋白主要参与铁的获取、ATP结合盒（ABC）转运系统和蛋白分泌途径。值得注意的是，大量蛋白被预测定位于外膜或含有信号肽，提示其可能在宿主-微生物相互作用中发挥作用，并可能与外膜囊泡等细胞外结构相关。这些蛋白应被视为与抗增殖组分相关的候选生物活性分子，而非已确认的功能效应因子。观察到的富集模式进一步提示，多种分子成分可能共同贡献了该生物活性，尽管这些候选分子的个体及联合功能作用仍需直接实验验证。总体而言，这些发现为系统鉴定与CRC抗增殖活性相关的菌群衍生候选分子提供了框架。