表观遗传结构决定心脏驻留巨噬细胞亚群的异质性及其抗原呈递功能

《Cardiovascular Research》:Distinct chromatin landscapes dictate resident cardiac macrophage lifecycles and functions

【字体: 大 中 小 】 时间:2026年10月07日 来源:Cardiovascular Research 12.5

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   摘要 目的稳态心脏中共存着三种驻留巨噬细胞亚群,它们表现出不同的起源、转录特征和功能。然而,调节心脏驻留巨噬细胞亚群异质性的潜在表观遗传结构尚不清楚,这限制了对其机制的理解和治疗靶向。方法与结果我们进行了批量和单细

摘要

目的

稳态心脏中共存着三种驻留巨噬细胞亚群,它们表现出不同的起源、转录特征和功能。然而,调节心脏驻留巨噬细胞亚群异质性的潜在表观遗传结构尚不清楚,这限制了对其机制的理解和治疗靶向。

方法与结果

我们进行了批量和单细胞 ATAC-seq 测序,以绘制小鼠驻留巨噬细胞亚群的染色质景观。将 ATAC-seq 与每个心脏巨噬细胞亚群的 RNA-seq 数据整合,揭示了两种主要的基于染色质可及性的细胞状态,这些状态与组织驻留性相关:一种 CCR2- 巨噬细胞染色质基础细胞状态,对应于驻留 TLF+ (TIMD4 + LYVE1 + FOLR2+) 和 CCR2-MHC-IIhi 亚群,这些亚群不需要单核细胞维持;另一种 CCR2+ 染色质基础细胞状态,对应于 CCR2 + MHC-IIhi 巨噬细胞,后者依赖于单核细胞的输入。利用足迹分析,我们鉴定了转录因子结合方面的亚群特异性差异,这解释了转录差异,包括 CCR2+ 巨噬细胞中富集的 AP-1 结合以及 TLF+ 巨噬细胞中富集的 MAF 家族因子结合。重要的是,我们证明髓系特异性缺失 Mafb 或 Maf 会使巨噬细胞亚群组成偏向 CCR2+ 巨噬细胞,并增加 TLF+ 巨噬细胞中的 MHC-II 表达。此外,我们确定了 IRF8 与 MHC-II 之间的联系,其中髓系特异性缺失 Irf8 仅消除了谱系追踪的驻留 CCR2- 亚群中的 MHC-II 表达,而不影响 CCR2+ 巨噬细胞,证明了 IRF8 在调节抗原呈递方面的亚群特异性依赖性。

结论

综上所述,这些数据表明组织驻留性决定了心脏巨噬细胞中的染色质可及性和转录因子结合,从而将表观遗传结构与单核细胞依赖性、独特的基因表达模式以及抗原呈递等关键功能联系起来。

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